不调用sklearn库,用python编写高斯混合聚类算法,并在iris数据上进行聚类实验,最后可视化

时间: 2024-03-21 16:43:40 浏览: 71
好的,以下是使用Python编写高斯混合聚类算法,并在Iris数据上进行聚类实验的代码。我们先从网上下载Iris数据集,并进行数据预处理: ```python import numpy as np # 读取数据集 with open('iris.data', 'r') as f: data = f.readlines() # 数据预处理 X = [] for i in range(len(data)): if data[i] != '\n': x = data[i].split(',')[:-1] X.append(list(map(float, x))) X = np.array(X) ``` 然后,我们实现高斯混合聚类算法: ```python from scipy.stats import multivariate_normal def GMM(X, K, max_iter): n, m = X.shape # 初始化参数 pi = np.full(shape=K, fill_value=1/K) means = np.random.rand(K, m) covs = np.array([np.eye(m)] * K) for i in range(max_iter): # E步骤 gamma = np.zeros((n, K)) for j in range(K): gamma[:, j] = pi[j] * multivariate_normal.pdf(X, means[j], covs[j]) gamma = (gamma.T / np.sum(gamma, axis=1)).T # M步骤 Nk = np.sum(gamma, axis=0) pi = Nk / n for j in range(K): means[j] = np.sum(X * gamma[:, j].reshape(-1, 1), axis=0) / Nk[j] x_mean = (X - means[j]) covs[j] = np.dot(gamma[:, j] * x_mean.T, x_mean) / Nk[j] return np.argmax(gamma, axis=1) ``` 最后,我们可视化聚类效果: ```python import matplotlib.pyplot as plt from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D # 进行聚类并可视化 labels = GMM(X, 3, 100) fig = plt.figure() ax = Axes3D(fig) ax.scatter(X[:, 0], X[:, 1], X[:, 2], c=labels) plt.show() ``` 运行完整代码后,将会得到Iris数据集的聚类可视化结果。
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