python 计算时间序列样本熵的代码
时间: 2023-08-06 20:04:00 浏览: 305
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以下是一个用于计算时间序列样本熵(Sample Entropy)的Python代码示例:
```python
import numpy as np
def sample_entropy(time_series, m, r):
"""
计算时间序列的样本熵(Sample Entropy)
参数:
time_series: 时间序列数据,类型为一维数组或列表
m: 子序列长度,用于计算样本熵的子序列长度
r: 阈值参数,用于定义相似性比较的阈值
返回值:
样本熵的计算结果,类型为浮点数
"""
n = len(time_series)
result = np.zeros(n-m+1)
for i in range(n-m+1):
sub_time_series = time_series[i:i+m]
# 计算与该子序列相似的数量(包括自身)
count = 0
for j in range(n-m+1):
if np.max(np.abs(sub_time_series - time_series[j:j+m])) <= r:
count += 1
# 将相似数量除以总体数量并取对数
result[i] = np.log(count / (n-m+1))
return -np.mean(result)
# 示例使用
time_series = [1, 2, 3, 1, 2, 3, 1, 2, 3]
m = 2
r = 0.2 * np.std(time_series)
entropy = sample_entropy(time_series, m, r)
print("Sample Entropy:", entropy)
```
在示例代码中,`sample_entropy`函数接受一个时间序列数据(例如列表或一维数组),子序列长度 `m` 和相似性阈值 `r` 作为输入参数。它使用嵌套循环来计算样本熵的值,并返回结果。
在示例中,我们使用了一个简单的时间序列 `[1, 2, 3, 1, 2, 3, 1, 2, 3]` 进行计算,并指定了子序列长度 `m=2` 和相似性阈值 `r=0.2`。
您可以将上述代码示例用于您的时间序列数据,并根据需要调整子序列长度和相似性阈值。
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