R语言绘制热图时,如何按每一列的和的大小排序画图,并呈现每一列的和
时间: 2024-05-08 13:20:58 浏览: 91
可以使用R语言的`heatmap()`函数绘制热图,并使用`sort()`函数按照每一列的和进行排序。
首先,假设你已经有一个数据矩阵`data`,可以使用如下代码计算每一列的和,并按照和进行排序:
```
col_sums <- colSums(data)
sorted_data <- data[, order(col_sums)]
```
上述代码中,`colSums()`函数计算每一列的和,`order()`函数返回按照和排序后的列索引,`data[, order(col_sums)]`则按照索引重新排列数据矩阵。
接下来,可以使用`heatmap()`函数绘制热图,并使用`add.expr`参数添加每一列的和:
```
heatmap(sorted_data,
Colv = NA,
Rowv = NA,
scale = "none",
add.expr = {
col_sums <- colSums(sorted_data)
for(i in 1:length(col_sums)) {
text(i - 0.5, nrow(sorted_data) + 1, col_sums[i], col = "black", cex = 0.8)
}
})
```
上述代码中,`Colv = NA`和`Rowv = NA`参数分别表示不绘制列聚类树和行聚类树;`scale = "none"`参数表示不对数据进行缩放;`add.expr`参数则添加计算出的每一列的和。在`add.expr`参数中,使用`colSums()`函数计算每一列的和,然后使用`text()`函数添加文本标签。
绘制出来的热图将按照每一列的和进行排序,并在顶部显示每一列的和。
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