SHELL脚本里面 # 文字 是什么意思
时间: 2023-09-24 19:11:38 浏览: 80
在Shell脚本中,#符号通常用于注释。在#符号后面的文字,直到该行的结尾,都会被视为注释,不会被Shell解释器执行。注释是用来解释代码的作用、调试代码、或者提醒自己或其他人对代码的理解的一种方法。注释可以是单行注释,也可以是多行注释。单行注释使用#符号,而多行注释则使用一对`<<`和`>>`符号包含起来,中间的文字都会被视为注释。注释可以提高代码的可读性,同时也方便维护和修改。
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echo "××××××欢迎使用字符串匹配系统×××××" while : do echo " ××××××××××××××××××" echo " × 请选择功能" × echo " × 0.检查程序功能"× echo " × 1.字符串匹配" × echo " × 2.排 序" × echo " × 3.查 找" × echo " × 4.数据可视化" × echo " × 5.退 出" × echo " ××××××××××××××××××" read -rsN1 number case $number in 0) sudo apt-get install bowtie2 sudo apt-get install dos2unix sudo apt-get install samtools ;; 1) dos2unix ref.fa dos2unix reads1.fq bowtie2-build ref.fa ref bowtie2 -x ref -U reads1.fq -S result1.sam echo "匹配完成" echo "匹配结果存入result1.sam" ;; 2) declare -a y1 declare -a y2 declare -a y3 y1=(`awk '{print $1}' result1.sam`) y2=(`awk '{print $4}' result1.sam`) y3=(`awk '{print $10}' result1.sam`) length=0 length=${#y1[@]} for((i=0;i<length;i++));do { echo "${y1[i+3]} ${y2[i+1]} ${y3[i]}">>result1.txt } done sort -n -k 2 -t " " result1.txt>>result2.txt #将result.txt以第二列排序,输出存储到result2.txt grep -v ' 0 ' result2.txt >> result3.txt #排除匹配结果为0的结果并保存在result3.txt里 echo "排序完成!结果已经放在result3.txt里面" ;; 3)echo "请输入查找的左/右边界" read l1 r1 cat result1.txt | awk '{if($2>='$l1'&&$2<='$r1'){print $0>"result.txt"}}' echo "查找结果已经放在了resuyt.txt文件里。" ;; 4) echo "数据可视化" samtools view -bS result1.sam > result1.bam #sam文件转换为bam格式 samtools sort result1.bam result1.sort #对bam文件进行排序 samtools index result1.sorted.bam #创建bai索引 samtools tview result1.sort.bam ref.fa #可视化界面展示 ;; 5)echo "你已安全退出,欢迎下次使用!" exit 0 ;; esac done
以下是对您提供的shell脚本的一些建议:
1. 在打印欢迎信息时,可以将其放在echo命令之外,以便更好地突出显示。
2. 在while循环内,尽量不要使用sudo,因为它会弹出sudo提示,需要用户手动输入密码。
3. 在功能菜单中,使用数字和文字混合的方式可能会让用户感到困惑。建议将数字和文字分开,并将它们对齐,以便更好地突出显示。
4. 在字符串匹配功能中,可以添加一些错误处理机制,例如检查输入文件是否存在等。
5. 在排序功能中,可以使用awk或者sed代替循环,以提高脚本的性能。
6. 在查找功能中,可以将awk命令的结果直接输出到结果文件中,而不是将结果存储在变量中,以节省内存。
7. 在数据可视化功能中,可以添加一些错误处理机制,例如检查输入文件是否存在等。
希望这些建议能够帮助您优化您的脚本!
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