假设列车在一段长 1500 米的试验线上运行。列车运行起点在 60 米处，运行方向沿着里程增加的方向运行。 列车数据：列车全长 55 米，最大牵引加速度为 1.7m/s/s，最大制动减 速度为 1.5m/s/s，牵引切断延时 6 秒。 线路情况： （1）试验时为保证安全，要求列车运行时不得超过 1400 米处。 全线要求 限速 100 公里每小时； （2）限速 1：在 400 米到 450 米之间，要求限速 90 公里每小时；（新增 的条件） （3）限速 2：在 600 米到 900 米之间，要求限速 40 公里每小时；（新增 的条件）

根据列车数据和线路情况，可以使用MATLAB进行列车运行自动控制系统的仿真设计。具体步骤如下：

1.根据列车数据，建立列车的运动学模型，并设置列车的初始状态和运行参数。

2.根据线路情况，设置列车在不同路段的限速条件，并进行速度控制。

3.对列车的运行进行仿真，模拟列车在不同条件下的运行状态，比如不同的路况、不同的速度等。

4.对列车的运行参数进行优化，比如最大速度、最小时间、最小能耗等。

具体实现代码如下：

% 列车数据
train_length = 55; % 列车全长
max_acc = 1.7; % 最大牵引加速度
max_dec = 1.5; % 最大制动减速度
delay_time = 6; % 牵引切断延时

% 线路情况
total_length = 1500; % 试验线总长
start_point = 60; % 列车起点
end_point = 1400; % 试验线终点
limit_speed = 100/3.6; % 全线限速100公里每小时
limit_speed_1 = 90/3.6; % 400到450米限速90公里每小时
limit_speed_2 = 40/3.6; % 600到900米限速40公里每小时

% 建立列车的运动学模型
t = 0:0.1:200; % 时间
s = zeros(1, length(t)); % 位置
v = zeros(1, length(t)); % 速度
a = zeros(1, length(t)); % 加速度

% 初始状态
s(1) = start_point;
v(1) = 0;
a(1) = 0;

% 模拟列车的运行过程
for i = 1:length(t)-1
    % 根据限速条件进行速度控制
    if s(i) >= 400 && s(i) <= 450
        limit = limit_speed_1;
    elseif s(i) >= 600 && s(i) <= 900
        limit = limit_speed_2;
    else
        limit = limit_speed;
    end
    
    % 根据列车的运动学模型进行运算
    if v(i) < limit
        a(i+1) = max_acc;
    elseif v(i) > limit
        a(i+1) = -max_dec;
    else
        a(i+1) = 0;
    end
    
    % 牵引切断延时
    if i > delay_time/0.1 && v(i-delay_time/0.1) == 0
        a(i+1) = 0;
    end
    
    % 更新列车的位置和速度
    v(i+1) = v(i) + a(i+1)*0.1;
    s(i+1) = s(i) + v(i+1)*0.1;
    
    % 判断列车是否到达试验线终点
    if s(i+1) >= end_point
        break;
    end
end

% 绘制列车的位置-时间曲线
plot(t(1:length(s)), s);
xlabel('时间/s');
ylabel('位置/m');
title('列车的位置-时间曲线');

根据上述代码，可以得到列车的位置-时间曲线，根据曲线可以判断列车是否在试验线上安全运行。