如何给viennarna配置Python

在安装ViennaRNA之后，你需要将ViennaRNA的Python库添加到Python的搜索路径中，以便Python能够找到该库并加载它。具体操作如下：

1. 打开终端或命令行界面，并输入以下命令来打开ViennaRNA的安装目录：

cd /usr/local/lib/python3.7/site-packages/

这里的路径是以macOS系统为例，如果你的系统不同，可能需要修改路径。

2. 在ViennaRNA的安装目录中，输入以下命令来复制ViennaRNA的Python库：

cp RNA.py /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.7/lib/python3.7/site-packages/
cp _RNA.so /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.7/lib/python3.7/site-packages/

这里的路径是以Python 3.7为例，如果你的Python版本不同，可能需要修改路径。如果提示权限不够，可以在命令前加sudo以管理员身份执行。

3. 完成以上步骤后，你可以在Python脚本中使用ViennaRNA的Python库进行RNA二级结构预测等操作。例如：

import RNA

seq = "AUGGCUAAGUCC"
s, mfe = RNA.fold(seq)
print(s)
print(mfe)

这个命令会对序列"AUGGCUAAGUCC"进行RNA二级结构预测，并输出预测得到的二级结构和最小自由能。

通过以上步骤，你可以配置ViennaRNA的Python库，以便在Python中使用ViennaRNA进行RNA分析。