采遗传算法写一个光谱特征选择python函数,带注释

时间: 2023-03-31 10:03:05 浏览: 76
好的,我可以回答这个问题。以下是一个采用遗传算法实现光谱特征选择的 Python 函数,带有注释: ```python import numpy as np from sklearn import datasets from sklearn.model_selection import train_test_split from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier def spectral_feature_selection(X, y, n_features, n_pop=50, n_gen=100): """ 采用遗传算法实现光谱特征选择 参数: X: 特征矩阵,形状为 (n_samples, n_features) y: 标签,形状为 (n_samples,) n_features: 需要选择的特征数 n_pop: 种群大小,默认为 50 n_gen: 迭代次数,默认为 100 返回: selected_features: 选择的特征的下标 """ # 定义适应度函数,使用随机森林分类器的准确率作为适应度 def fitness(individual): selected_features = np.where(individual == 1)[] if len(selected_features) == : return X_selected = X[:, selected_features] X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X_selected, y, test_size=.3, random_state=42) clf = RandomForestClassifier(n_estimators=100, random_state=42) clf.fit(X_train, y_train) return clf.score(X_test, y_test) # 初始化种群 population = np.random.randint(, 2, size=(n_pop, X.shape[1])) # 迭代 for i in range(n_gen): # 计算适应度 fitness_values = np.apply_along_axis(fitness, 1, population) # 选择 selected_indices = np.argsort(fitness_values)[::-1][:n_pop // 2] selected_population = population[selected_indices] # 交叉 offspring_population = np.zeros_like(selected_population) for j in range(n_pop // 2): parent1 = selected_population[j] parent2 = selected_population[np.random.randint(, n_pop // 2)] crossover_point = np.random.randint(1, X.shape[1] - 1) offspring1 = np.concatenate([parent1[:crossover_point], parent2[crossover_point:]]) offspring2 = np.concatenate([parent2[:crossover_point], parent1[crossover_point:]]) offspring_population[2*j] = offspring1 offspring_population[2*j+1] = offspring2 # 变异 mutation_indices = np.random.choice(n_pop, size=n_pop // 10, replace=False) mutation_population = population[mutation_indices] mutation_population[np.arange(n_pop // 10), np.random.randint(, X.shape[1], size=n_pop // 10)] ^= 1 # 合并 population = np.concatenate([selected_population, offspring_population, mutation_population]) # 计算最终适应度 fitness_values = np.apply_along_axis(fitness, 1, population) # 选择最优个体 best_individual = population[np.argmax(fitness_values)] # 选择特征 selected_features = np.where(best_individual == 1)[][:n_features] return selected_features ``` 希望这个函数能够帮到你!

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