代码解释: with h5py.File(file, 'r') as f: data = f['diagnosis'][:] label = f['diagnosis'].attrs['IsDisrupt'] train_data.append(data) train_labels.append(label)
时间: 2024-04-01 16:31:50 浏览: 113
这段代码是读取一个HDF5格式的文件,其中包含了诊断数据和标签。具体来说:
- 第一行打开HDF5文件,并使用'r'模式只读方式打开文件。
- 第二行读取文件中的'diagnosis'数据集,并将其存储在变量'data'中。
- 第三行读取'diagnosis'数据集的属性'IsDisrupt',并将其存储在变量'label'中。
- 第四行将'data'添加到'train_data'列表中。
- 第五行将'label'添加到'train_labels'列表中。
最终,这个代码块会不断读取HDF5文件中的数据集和属性,并将其添加到对应的列表中,以供后续的训练或其他处理。
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代码解释:with open(os.path.join(os.path.dirname(__file__), 'Config.json'), 'r') as json_file: config = json.load(json_file) shots = {'train': config['shots']['train'], 'val': config['shots']['val'], 'test': config['shots']['test']} directory = config['directory'] result = {str(i): np.array([]) for i in range(6)} files = os.listdir(directory) for file in files: try: print(file) shot = shots[file] shot = list(eval(shot)) for st in shot: f = h5py.File(os.path.join(directory, file, '{}.hdf5'.format(st)), 'r') dataset = f.get('diagnosis') data = dataset[:] for i in range(6): result['{}'.format(i)] = np.concatenate((result['{}'.format(i)], data[i])) except Exception as e: print(e)
这段代码的主要作用是读取一个JSON格式的配置文件,然后从配置文件中获取一些参数值,最后遍历指定目录下的所有文件,打开每个文件中的数据集,并将其中的数据按照一定的规则存储到一个名为`result`的字典对象中。
具体来说,代码首先通过`open()`函数打开了一个名为`Config.json`的配置文件,并通过`json.load()`函数将其解析成一个Python字典对象`config`,其中包含了一些参数的取值。然后,从`config`字典中获取了三个键值对,分别是`'shots'`、`'directory'`和`'result'`。其中,`'shots'`是一个字典,包含了三个键值对,分别是`'train'`、`'val'`和`'test'`,对应训练集、验证集和测试集的样本数量;`'directory'`是一个字符串,表示要读取的数据文件所在的目录路径;`'result'`是一个字典,用于存储处理后的数据。接下来,代码使用`os.listdir()`函数列出了指定目录下的所有文件和子目录的名称,并将其存储到`files`列表中。
然后,代码使用一个`for`循环遍历`files`列表中的每个文件名。在每次循环中,代码首先尝试从`shots`字典中获取当前文件名对应的样本数量`shot`,对其进行了一些处理,然后遍历`shot`列表中的每个元素,依次打开对应的数据文件,并从中读取出名为`diagnosis`的数据集。接着,代码使用一个`for`循环遍历数据集中的每一行,将其中的数据按照一定的规则存储到`result`字典中。具体来说,`result`字典是一个包含6个键值对的字典,其中每个键对应一个长度为0的Numpy数组,表示当前处理的数据。在每次循环中,代码将数据集中第`i`行的数据存储到`result`字典中第`i`个键对应的Numpy数组中,并使用`np.concatenate()`函数将其与之前存储的数据拼接起来。
最后,如果在处理过程中发生了任何异常,代码将打印该异常的信息。
data = pd.read_csv("data.csv") data.replace("M",1,inplace=True) data.replace("B",0,inplace=True) #获取特征x和特征y X = data.iloc[:, 3:5].values x = np.array(X) y = data.diagnosis #拆分训练集与测试集 #基于线性核函数的svm绘制分类边界 model = svm.SVC(kernel = 'linear') model.fit(x, y) #绘制分类边界线 l,r = x[:,0].min()-1,x[:,0].max()+1 b,t = x[:,1].min()-1,x[:,1].max()+1 n = 500 grid_x, grid_y = np.meshgrid(np.linspace(l, r, n), np.linspace(b, t, n)) #grid_x与geid_y押平了组成模型的输入,预测输出 mesh_x = np.column_stack((grid_x.ravel(), grid_y.ravel())) pred_mesh_y = model.predict(mesh_x) grid_z = pred_mesh_y.reshape(grid_x.shape) #绘制这些点 plt.figure('SVM', facecolor = 'lightgray') plt.title('SVM', fontsize = 16) plt.xlabel('x', fontsize = 14) plt.ylabel('y', fontsize = 14) plt.pcolormesh(grid_x, grid_y, grid_z, cmap = 'gray') plt.scatter(x[:, 0], x[:, 1], s = 60, c = y, label = 'points', cmap = 'jet') plt.legend() plt.show()
这段代码使用了支持向量机(SVM)算法对数据进行分类,并绘制了分类边界线。首先,对数据进行预处理,将"M"替换成1,"B"替换成0。然后使用特征x和特征y进行分类,其中x取data的第3到第5列,y取data的diagnosis列。接着,对数据进行拆分,分为训练集和测试集。然后,创建SVM模型对象,并使用fit()方法进行训练。接下来,以线性核函数为基础,使用meshgrid()函数生成网格点坐标,并将其输入SVM模型进行预测,得到分类结果。最后,使用pcolormesh()函数绘制分类边界线,并使用scatter()函数绘制数据点。其中,数据点用颜色表示类别,分类边界线用灰度表示。
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