lasso回归构建预后模型分为训练集验证集R语言代码
时间: 2023-09-19 22:10:52 浏览: 342
以下是使用R语言进行Lasso回归模型的训练、验证和测试的示例代码:
```
# 加载需要的库
library(glmnet)
# 加载数据
X <- as.matrix(read.csv("features.csv", header=TRUE))
y <- as.matrix(read.csv("labels.csv", header=TRUE))
# 将数据集分为训练集、验证集和测试集
set.seed(0) # 设置随机数种子
train_index <- sample(1:nrow(X), size=0.6*nrow(X), replace=FALSE)
val_index <- sample(setdiff(1:nrow(X), train_index), size=0.2*nrow(X), replace=FALSE)
test_index <- setdiff(setdiff(1:nrow(X), train_index), val_index)
X_train <- X[train_index, ]
y_train <- y[train_index]
X_val <- X[val_index, ]
y_val <- y[val_index]
X_test <- X[test_index, ]
y_test <- y[test_index]
# 定义Lasso回归模型并训练
lasso.fit <- cv.glmnet(X_train, y_train, alpha=1)
# 在验证集上评估模型性能
score_val <- max(lasso.fit$cvm)
cat("Validation R^2 score:", 1-score_val/var(y_val), "\n")
# 在测试集上评估模型性能
score_test <- max(lasso.fit$cvm) + lasso.fit$glmnet.fit$dev.ratio*lasso.fit$lambda.min
cat("Test R^2 score:", 1-score_test/var(y_test), "\n")
```
其中,`features.csv`为特征数据的文件,`labels.csv`为标签数据的文件。首先加载数据,然后使用`sample`函数将数据集分为训练集、验证集和测试集。接着,使用`cv.glmnet`函数定义Lasso回归模型并使用训练集进行训练。最后,在验证集和测试集上分别评估模型性能并输出R^2得分。在实际应用中,还可以使用交叉验证等方法进行更加准确的模型选择和评估。
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