mricron批量转化dicom为nii bvec

你可以使用 C知道提供的以下代码来批量将 DICOM 文件转换为 NIfTI 格式（包括 NIfTI 图像和 bvec 文件）：

import os
import subprocess

# 定义 DICOM 文件夹和输出文件夹的路径
dicom_folder = '/path/to/dicom/folder'
output_folder = '/path/to/output/folder'

# 循环处理 DICOM 文件夹中的每个文件
for file_name in os.listdir(dicom_folder):
    if file_name.endswith('.dcm'):
        dicom_file = os.path.join(dicom_folder, file_name)
        output_prefix = os.path.splitext(file_name)[0]
        
        # 调用 mricron 命令行工具执行转换
        subprocess.run(['dcm2niix', '-f', '%p_%s', '-o', output_folder, dicom_file])
        
        # 重命名输出文件
        nii_file = os.path.join(output_folder, output_prefix + '.nii.gz')
        bvec_file = os.path.join(output_folder, output_prefix + '.bvec')
        
        new_nii_file = os.path.join(output_folder, output_prefix + '_new.nii.gz')
        new_bvec_file = os.path.join(output_folder, output_prefix + '_new.bvec')
        
        os.rename(nii_file, new_nii_file)
        os.rename(bvec_file, new_bvec_file)

print('DICOM 转换为 NIfTI 和 bvec 完成！')

请确保你已经安装了 mricron 工具，并将其添加到系统的 PATH 环境变量中。这段代码会遍历指定的 DICOM 文件夹中的所有 DICOM 文件，调用 dcm2niix 工具将其转换为 NIfTI 和 bvec 文件。转换后的文件将保存在指定的输出文件夹中，并按照原始 DICOM 文件的名称进行命名。