plink 怎么把vcf文件转换为.map文件

你可以使用plink软件将vcf文件转换为map文件。具体的命令如下：

plink --vcf your_file.vcf --out your_output --recode --tab --allow-extra-chr

其中，"--vcf"选项指定输入的vcf文件名，"--out"选项指定输出文件的前缀名，"--recode"选项表示转换为plink格式，"--tab"选项表示输出为tab分隔的文件，"--allow-extra-chr"选项允许额外的染色体编号。执行该命令后，将会生成三个文件：your_output.map、your_output.ped和your_output.log。其中，your_output.map即为转换后的map文件。

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用plink把vcf文件转成plink文件

可以使用以下命令将vcf文件转换为plink文件：

plink --vcf input.vcf --make-bed --out output

其中，input.vcf是vcf文件的路径和文件名，output是输出文件的前缀。转换后的plink文件将生成三个文件：output.bed、output.bim和output.fam。

用vcftools把vcf文件转化成plink文件

可以使用以下命令将vcf文件转换为plink文件：

vcftools --vcf input.vcf --plink --out output

其中，input.vcf是输入的vcf文件名，output是输出的plink文件名。