all_signals, fields = wfdb.rdsamp(os.path.join(data_path, record)) annotations = wfdb.rdann(os.path.join(data_path, record), 'atr')解释一下
时间: 2023-09-26 19:09:27 浏览: 167
这段代码是使用 WFDB 库对心电信号数据进行读取和解析的过程。
`wfdb.rdsamp()` 函数用于读取心电信号数据,其中 `os.path.join(data_path, record)` 是心电信号数据的路径和文件名。该函数返回两个值,`all_signals` 是一个二维数组,包含了所有导联的信号数据,`fields` 是一个字典,包含了数据的相关信息,如采样率、导联名称等。
`wfdb.rdann()` 函数用于读取相应的注释文件,其中 `os.path.join(data_path, record)` 是心电信号数据的路径和文件名, `'atr'` 表示使用标准的 MIT-BIH 格式的注释文件。该函数返回一个 `Annotation` 对象,包含了注释的相关信息,如每个心拍的类型和位置等。
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import wfdb import numpy as np import os import cv2 from PIL import Image import matplotlib.pyplot as plt # 设置数据集路径 data_path = 'mit-bih-arrhythmia-database-1.0.0/' # 设置输出路径 output_path = 'ImageMITBIH/' N_beats_pos = [] A_beats_pos = [] V_beats_pos = [] F_beats_pos = [] L_beats_pos = [] R_beats_pos = [] qita_beats_pos = [] # 读取数据集中所有记录的文件名 records = wfdb.get_record_list('mitdb') print('file list =', records) # 循环遍历每个记录文件 for record in records: print('\n') print('Processing record:', record) # 读取记录文件中的信号和标注信息 all_signals, fields = wfdb.rdsamp(os.path.join(data_path, record)) signals = [x[0] for x in all_signals] annotations = wfdb.rdann(os.path.join(data_path, record), 'atr') print('signals =', signals) print('signals_amount =', len(signals)) print('fields =', fields) print('annotations =', annotations) # 获取每个心拍的位置和类别 beats_pos = annotations.sample beats_labels = annotations.symbol print('beats_pos =', beats_pos) print('pos_amount =', len(beats_pos)) print('beats_labels =', beats_labels) print('labels_amount =', len(beats_labels)) print('labels_forms =', list(set(beats_labels))) for i in range(len(beats_labels)): if beats_labels[i] == 'N': # 正常心拍 N_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'A': # 房性早搏 A_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'V': # 室性早搏 V_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'F': # 室性融合波 F_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'L': # 左束传导受阻 L_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'R': # 右束传导受阻 R_beats_pos.append(beats_pos[i]) else: # 其他异常心拍或无效信号 qita_beats_pos.append(beats_pos[i])解释每一句的意思
这是一段 Python 代码,用于处理心电图数据集。下面是对代码中每一句的解释:
1. `import wfdb import numpy as np import os import cv2 from PIL import Image import matplotlib.pyplot as plt`:导入需要用到的 Python 库。
2. `data_path = 'mit-bih-arrhythmia-database-1.0.0/'`:设置数据集路径。
3. `output_path = 'ImageMITBIH/'`:设置输出路径。
4. `N_beats_pos = [] A_beats_pos = [] V_beats_pos = [] F_beats_pos = [] L_beats_pos = [] R_beats_pos = [] qita_beats_pos = []`:定义保存不同类别心拍位置的列表。
5. `records = wfdb.get_record_list('mitdb')`:获取数据集中所有记录的文件名。
6. `all_signals, fields = wfdb.rdsamp(os.path.join(data_path, record))`:读取记录文件中的信号和标注信息。
7. `signals = [x[0] for x in all_signals]`:将所有信号提取出来并保存在一个列表中。
8. `annotations = wfdb.rdann(os.path.join(data_path, record), 'atr')`:读取记录文件中的标注信息。
9. `beats_pos = annotations.sample`:获取每个心拍在信号中的位置。
10. `beats_labels = annotations.symbol`:获取每个心拍的类别。
11. `for i in range(len(beats_labels)): if beats_labels[i] == 'N': N_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'A': A_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'V': V_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'F': F_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'L': L_beats_pos.append(beats_pos[i]) if beats_labels[i] == 'R': R_beats_pos.append(beats_pos[i]) else: qita_beats_pos.append(beats_pos[i])`:按照心拍类别将它们的位置保存在对应的列表中。
代码的目的是将心电图数据集中的心拍类别和位置提取出来,并根据不同类别保存在不同的列表中,以便进行后续处理。
wfdb.rdsamp
`wfdb.rdsamp`是一个Python函数,它是WFDB软件包(PhysioNet中的开源软件包)中的一部分。它被用来读取和解析WFDB格式的生理信号数据,并将其转换为Python中的NumPy数组格式。该函数需要两个参数:记录名称和记录路径。例如,以下代码将读取名为`100`的记录,该记录位于`./data/`目录中:
```
import wfdb
record_name = '100'
record_path = './data/'
signals, fields = wfdb.rdsamp(record_name, pbdir=record_path)
```
其中`signals`是包含生理信号数据的NumPy数组,`fields`是一个字典,包含记录的元数据。
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