lammpstrj转csv

时间: 2023-07-09 13:52:52 浏览: 14
`lammpstrj`文件是LAMMPS分子动力学模拟程序输出的轨迹文件,其中包含了模拟系统在不同时间步的状态信息。如果你需要将`lammpstrj`文件转换为`csv`格式,可以使用Python中的pandas库进行转换。 以下是一个将`lammpstrj`文件转换为`csv`文件的例子: ```python import pandas as pd # 读取lammpstrj文件 with open('output.lammpstrj', 'r') as f: lines = f.readlines() # 解析数据 data = [] for i, line in enumerate(lines): if i >= 9: # 跳过文件头 line = line.strip().split() data.append(line) # 转换为DataFrame对象 df = pd.DataFrame(data, columns=['id', 'type', 'x', 'y', 'z', 'nx', 'ny', 'nz']) # 将数据写入csv文件 df.to_csv('output.csv', index=False) ``` 在上面的代码中,我们首先使用`open`函数读取`lammpstrj`文件,并使用`readlines`方法将文件内容读取成一个列表。然后,我们使用循环遍历列表,并解析每一行数据。解析后的数据存储在一个列表中,我们使用`pd.DataFrame`函数将其转换为一个DataFrame对象。最后,我们使用`to_csv`方法将DataFrame对象写入csv文件中。 需要注意的是,在上面的代码中,我们假设`lammpstrj`文件的前9行是文件头,需要跳过。如果你的文件头不是9行,需要根据实际情况进行修改。此外,我们也假设`lammpstrj`文件中包含了`id`、`type`、`x`、`y`、`z`、`nx`、`ny`、`nz`等8个字段,如果你的文件中包含了其他字段,需要修改`columns`参数的值。

最新推荐

基于51单片机的usb键盘设计与实现(1).doc

基于51单片机的usb键盘设计与实现(1).doc

"海洋环境知识提取与表示:专用导航应用体系结构建模"

对海洋环境知识提取和表示的贡献引用此版本:迪厄多娜·察查。对海洋环境知识提取和表示的贡献:提出了一个专门用于导航应用的体系结构。建模和模拟。西布列塔尼大学-布雷斯特,2014年。法语。NNT:2014BRES0118。电话:02148222HAL ID:电话:02148222https://theses.hal.science/tel-02148222提交日期:2019年HAL是一个多学科的开放存取档案馆,用于存放和传播科学研究论文,无论它们是否被公开。论文可以来自法国或国外的教学和研究机构,也可以来自公共或私人研究中心。L’archive ouverte pluridisciplinaire论文/西布列塔尼大学由布列塔尼欧洲大学盖章要获得标题西布列塔尼大学博士(博士)专业:计算机科学海洋科学博士学院对海洋环境知识的提取和表示的贡献体系结构的建议专用于应用程序导航。提交人迪厄多内·察察在联合研究单位编制(EA编号3634)海军学院

react中antd组件库里有个 rangepicker 我需要默认显示的当前月1号到最后一号的数据 要求选择不同月的时候 开始时间为一号 结束时间为选定的那个月的最后一号

你可以使用 RangePicker 的 defaultValue 属性来设置默认值。具体来说,你可以使用 moment.js 库来获取当前月份和最后一天的日期,然后将它们设置为 RangePicker 的 defaultValue。当用户选择不同的月份时,你可以在 onChange 回调中获取用户选择的月份,然后使用 moment.js 计算出该月份的第一天和最后一天,更新 RangePicker 的 value 属性。 以下是示例代码: ```jsx import { useState } from 'react'; import { DatePicker } from 'antd';

基于plc的楼宇恒压供水系统学位论文.doc

基于plc的楼宇恒压供水系统学位论文.doc

"用于对齐和识别的3D模型计算机视觉与模式识别"

表示用于对齐和识别的3D模型马蒂厄·奥布里引用此版本:马蒂厄·奥布里表示用于对齐和识别的3D模型计算机视觉与模式识别[cs.CV].巴黎高等师范学校,2015年。英语NNT:2015ENSU0006。电话:01160300v2HAL Id:tel-01160300https://theses.hal.science/tel-01160300v22018年4月11日提交HAL是一个多学科的开放获取档案馆,用于存放和传播科学研究文件,无论它们是否已这些文件可能来自法国或国外的教学和研究机构,或来自公共或私人研究中心。L’archive ouverte pluridisciplinaire博士之路博士之路博士之路在获得等级时,DOCTEURDE L'ÉCOLE NORMALE SUPERIEURE博士学校ED 386:巴黎中心数学科学Discipline ou spécialité:InformatiquePrésentée et soutenue par:马蒂厄·奥布里le8 may 2015滴度表示用于对齐和识别的Unité derechercheThèse dirigée par陪审团成员équipe WILLOW(CNRS/ENS/INRIA UMR 8548)慕尼黑工业大学(TU Munich�

valueError: Pandas data cast to numpy dtype of object. Check input data with np.asarray(data).

这个错误通常发生在使用 Pandas DataFrame 时,其中包含了一些不能被转换为数字类型的数据。 解决方法是使用 `pd.to_numeric()` 函数将数据转换为数字类型。例如: ```python import pandas as pd import numpy as np # 创建一个包含字符串和数字的 DataFrame df = pd.DataFrame({'A': ['a', 'b', 'c'], 'B': [1, 2, '3']}) # 尝试将整个 DataFrame 转换为数字类型会报错 np.asarray(df, dtype=np.float) # 使

基于VC--的五子棋程序设计与实现毕业设计.doc

基于VC--的五子棋程序设计与实现毕业设计.doc

体系结构驱动的普遍性应用程序中

体系结构驱动的普遍性应用程序的自主适应艾蒂安·甘德里勒引用此版本:艾蒂安·甘德里勒。由体系结构驱动的普遍性应用程序的自主适应。无处不在的计算。格勒诺布尔大学,2014年。法语。NNT:2014GRENM078。电话:01215004HAL ID:电话:01215004https://theses.hal.science/tel-01215004提交日期:2015年HAL是一个多学科的开放存取档案馆,用于存放和传播科学研究论文,无论它们是否被公开。论文可以来自法国或国外的教学和研究机构,也可以来自公共或私人研究中心。L’archive ouverte pluridisciplinaire论文要获得的等级格勒诺布尔大学博士专业:计算机科学部长令:2006年提交人艾蒂安·G·安德里尔论文由Philippe LAlanda指导由Stephanie CHollet共同指导在格勒诺布尔计算机科学实验室编写数学、信息科学与技术、计算机科学博士体系结构驱动的普遍性应用程序的自主适应论文�

STM32F103 RCT6 LCD显示正弦波并且设置可以调节振幅的触摸按键代码

以下是基于STM32F103RCT6和Keil MDK-ARM开发环境的LCD显示正弦波并且设置可以调节振幅的触摸按键代码: ```c #include "stm32f10x.h" #include "lcd.h" //LCD驱动库 #include "math.h" //数学库 #define PI 3.14159 //圆周率 void delay_ms(uint16_t n); int main(void) { float amplitude = 20; //振幅 float frequency = 1; //频率 float phase = 0; //相位

我国软件和信息技术服务业的发展现状及存在的问题.pdf

我国软件和信息技术服务业的发展现状及存在的问题.pdf