首页run.sh: line 9: `p = PDBParser()'

run.sh: line 9: `p = PDBParser()'

时间: 2024-09-07 20:06:19 浏览: 68

解决docker CMD/ENTRYPOINT执行sh脚本报: not found/run.sh:

Dockerfile配置没有问题，为什么执行ENTRYPOINT命令时一直错误？容器一启动就退出了。查了不少资料，想了好久才发现原因。 run.sh是被COPY指令复制到容器中的，而本机是windows，默认的换行符是\n，故而复制过去无法被执行。解决办法很简单，切换文件格式为LF即可。补充知识：docker中启动容器时CMD调用的sh脚本中if命令报未预期的符号 if[[的解决办法最近通过Dockerfile编写镜像，CMD中调用的是sh脚本（start.sh）进行启动容器，通过docker run启动时，启动不成功，进行docker logs 容器ID，发现报错为：未预期的符

这个错误信息"run.sh: line 9: `p = PDBParser()'": 这是一个常见的Shell脚本错误，通常发生在尝试运行Python代码的时候。在这个例子中，`PDBParser()`看起来像是来自BioPython库（一种用于生物信息学数据处理的Python库），其中`PDBParser`是用来解析PDB文件的一个类。错误表明在`run.sh`文件的第9行，尝试直接在shell命令中创建了一个`PDBParser`对象，但是Shell并不知道如何解释Python表达式。在Shell脚本中，你应该使用`python`命令来执行包含Python代码的行，比如： ```sh python -c "from Bio.PDB import PDBParser; p = PDBParser()" ``` 或者将Python代码放在一个单独的Python文件中，然后在`run.sh`中通过`python`命令来执行那个文件： ```sh python my_script.py ``` 如果`my_script.py`的内容是： ```python from Bio.PDB import PDBParser p = PDBParser() ```

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