ukb数据转换rs号

根据提供的引用内容，ukb数据转换为rs号的具体步骤如下：
首先，通过执行修改后的PHESANT现象扫描量化AGE效应，将编码的UKB数据转换为可用格式。然后，编译UK Biobank变量元数据并将所有数据转储到SQL数据库中。接下来，使用ukbconv程序将数据集"ukbN.enc_ukb"转换为各种标准格式，例如csv，docs，sas，stata，r等数据格式。如果需要提取用到的一部分数据，可以使用ukbconv命令提取数据。最后，使用ukbunpack程序对加密的数据集进行解密和解压缩，生成一个自定义的UKB格式文件"ukbN.enc_ukb"。

相关问题

[> a-read. table('PE. vcf', sep '‚header =F) > c<-separate (data = a, col = "VIO", sep = ":", into = c('ES", "SE", "LP", "AF", "SS", "ID") , remove = TRUE) > write. csv(C, file="ukb-d-I9_VTE. csv") Error in as. data. frame. default (x[ [i]], optional = TRUE) : cannot coerce class *"'function"' to a data. frame

这个错误通常表示您的代码中存在语法错误。在这段代码中，您在第一行中使用了一个点而不是逗号来分隔参数。此外，您在第二行中使用了`data = a`，但是在之前的代码中，您使用`a-read. table`而不是将其分配给变量`a`。您在第三行中使用了大小写不一致的变量`c`，并且在第四行中使用了大小写不一致的变量`C`。最后，这个错误提到了一个不能将函数强制转换为数据框的问题。请检查您的代码，并确保所有变量和函数都被正确命名和调用。如果您仍然无法解决问题，请提供更多的相关信息和代码细节，以便我可以更好地帮助您。

我的代码如下：install.packages(‘devtools’) devtools::install_github(‘MRCIEU/TwoSampleMR’) library(TwoSampleMR) #加载R包 che<-extract_instruments(outcomes='ukb-b-1489', clump=TRUE, access_token = NULL) chd<-extract_outcome_data( snps = che$SNP, outcomes ='ieu-a-7', proxies = FALSE, maf_threshold = 0.01, access_token = NULL) mydata <- harmonise_data( exposure_dat=che, outcome_dat=chd, action= 2 ) res <- mr(mydata) res OR<-generate_odds_ratios(res) 要输入什么代码才能使用maximum likelihood进行MR分析

要使用最大似然方法进行MR分析，可以使用TwoSampleMR包中的`mr_ml()`函数。使用该函数的语法如下：

res_ml <- mr_ml(data, prior_variance = 0.04, verbose = TRUE)

其中，`data`是通过`harmonise_data()`函数协调的数据集，`prior_variance`是一个可选参数，可以用来指定先验方差（默认值为0.04），`verbose`参数是一个逻辑值，用于控制是否输出详细信息（默认值为TRUE）。

请注意，最大似然方法是一种计算量较大的方法，可能需要较长的计算时间。