R语言 使用ggpairs()函数绘制相关性热力图,如何设置背景为白色
时间: 2024-09-16 18:05:20 浏览: 49
相关性网络图_R语言绘制SCI图的输入文件及代码.rar
在R语言中,`ggpairs()`函数来自`GGally`包,用于创建变量间的双变量图形矩阵。如果你想让绘制的相关性热力图背景变为白色,可以调整绘图的主题或者修改底层的`geom_tile()`层。这里是一个例子:
```R
library(GGally)
# 加载数据集 (假设你已经有了数据)
data(iris)
df <- iris
# 设置背景为白色
theme_set(theme_bw(base_size = 16)) # 使用基础白主题
ggpairs(df, mapping = aes(colour = Species), lower = "blank", # 设置下部空白
diagonal = list(geom_tile(aes(fill = ..level..), colour = "white"), # 热力图背景设为白色
show.legend = FALSE)
# 如果你想保留默认的灰色背景,可以指定具体的颜色:
ggpairs(df, mapping = aes(colour = Species), lower = "blank",
diagonal = list(geom_tile(aes(fill = ..level..), colour = "gray95"),
show.legend = FALSE)
```
在这个例子中,`theme_set()`设置了全局的主题为白色,而`geom_tile()`的`colour`属性则用于指定条形图的颜色(这里设为了白色)。`lower = "blank"`参数让下部网格区域为空白,仅显示热力图。
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