r语言主成分分析案例
时间: 2023-12-07 22:04:07 浏览: 154
主成分分析例子
当然!我可以为你提供一个关于R语言主成分分析的案例。假设我们有一个数据集,包含了一些关于人口统计学特征的数据,例如年龄、性别、教育水平、收入等。我们想要利用主成分分析来减少这些特征的维度,并找到能够解释数据变异最大的主成分。
首先,我们需要加载必要的R包并导入数据集。假设我们的数据集名为"population_data.csv",并包含以下列:age, gender, education, income。
```R
# 加载R包
library(dplyr)
library(FactoMineR)
library(FactoMineR.data)
# 导入数据集
data <- read.csv("population_data.csv")
```
接下来,我们需要对数据进行预处理,包括缺失值处理和标准化。我们可以使用dplyr包中的函数来处理数据。
```R
# 处理缺失值
data <- na.omit(data)
# 标准化数据
data_scaled <- data %>%
select(-gender) %>%
scale()
```
现在我们可以进行主成分分析了。使用FactoMineR包中的函数进行主成分分析,并选择合适的主成分数量。
```R
# 主成分分析
pca <- PCA(data_scaled, graph = FALSE)
# 查看主成分贡献率
eig.val <- get_eigenvalue(pca)
eig.val$eigenvalue_ratio
```
根据主成分的贡献率,我们可以选择保留一定数量的主成分。假设我们选择保留前两个主成分。
```R
# 选择前两个主成分
pca_dim <- dimdesc(pca, axes = c(1, 2), proba = 0.05)
# 查看主成分的解释变异度和变量贡献度
pca_dim$contrib
```
最后,我们可以绘制主成分分析的结果,包括样本点和变量的投影。
```R
# 绘制主成分分析结果
plot.PCA(pca, choix = "ind", habillage = 1, title = "PCA Plot")
# 绘制变量的投影
plot.PCA(pca, choix = "var", title = "Variable Projection")
```
这就是一个简单的R语言主成分分析案例。通过主成分分析,我们可以减少数据的维度,并找到解释数据变异最大的主成分。希望对你有所帮助!
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