python .loom文件读写
时间: 2024-01-16 10:19:06 浏览: 521
python 读文件
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在Python中,可以使用scanpy库来读取和写入.loom文件。下面是一个示例演示如何读取和写入.loom文件:
读取.loom文件:
```python
import scanpy as sc
# 读取.loom文件
data = sc.read_loom('brain10x.loom', sparse=True)
```
写入.loom文件:
```python
import scanpy as sc
# 创建一个Scanpy对象
adata = sc.AnnData(X=data)
# 写入.loom文件
adata.write_loom('output.loom')
```
请注意,上述示例中的'brain10x.loom'是要读取的.loom文件的路径,'output.loom'是要写入的.loom文件的路径。你可以根据实际情况修改这些路径。
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