python .loom文件读写

在Python中，可以使用scanpy库来读取和写入.loom文件。下面是一个示例演示如何读取和写入.loom文件：
读取.loom文件：
import scanpy as sc

# 读取.loom文件
data = sc.read_loom('brain10x.loom', sparse=True)
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写入.loom文件：
import scanpy as sc

# 创建一个Scanpy对象
adata = sc.AnnData(X=data)

# 写入.loom文件
adata.write_loom('output.loom')
登录后复制
请注意，上述示例中的'brain10x.loom'是要读取的.loom文件的路径，'output.loom'是要写入的.loom文件的路径。你可以根据实际情况修改这些路径。

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python loomp库中的loom

在Python的loom库中，可以使用add_hierarchy函数来创建层次结构。该函数的用法如下所示：add_hierarchy(loom=loom, hierarchy=create_hierarchy(level.1.name="Mouse", level.2.name="Toy Datasets", level.3.name=""))。1
引用[.reference_title]

1 R语言与python语言读写loom文件[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2allinsert_cask~default-1-null.142^v92^chatsearchT3_1"}}] [.reference_item style="max-width: 100%"]
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