基于Nyström的谱聚类算法
时间: 2024-06-17 11:03:23 浏览: 304
基于Nyström的谱聚类算法是一种常用的谱聚类算法。谱聚类算法是一种基于图论的聚类方法,将数据集看作图中的节点,通过计算相似度矩阵来构建图,并对图进行谱分解,将得到的特征向量作为输入进行聚类。
基于Nyström的谱聚类算法是在谱聚类算法的基础上进行改进的。它通过使用Nyström采样方法来加速矩阵的计算,从而减少计算量和存储空间的消耗。具体来说,该算法先从原始数据集中随机选择一部分数据点作为样本点,然后通过计算样本点之间的相似度来构建相似度矩阵,并对该矩阵进行谱分解。最后,利用得到的特征向量进行聚类。
与传统的谱聚类算法相比,基于Nyström的谱聚类算法具有以下优点:
- 计算速度更快:采用Nyström采样方法可以大大减少计算量和存储空间的消耗。
- 可以处理大规模数据集:由于采用了Nyström采样方法,因此该算法可以处理大规模数据集。
- 聚类效果更好:实验证明,基于Nyström的谱聚类算法在某些情况下可以获得更好的聚类效果。
相关问题
密度加权Nyström谱聚类代码
以下是密度加权Nyström谱聚类的Python代码:
import numpy as np
from scipy import sparse
from sklearn.cluster import KMeans
from sklearn.metrics.pairwise import rbf_kernel
from sklearn.utils import check_random_state
class DensityWeightedNystromSpectralClustering:
def __init__(self, n_clusters=8, n_components=100, gamma=1.0, random_state=None):
self.n_clusters = n_clusters
self.n_components = n_components
self.gamma = gamma
self.random_state = random_state
def fit(self, X):
rng = check_random_state(self.random_state)
n_samples = X.shape[0]
W = rbf_kernel(X, gamma=self.gamma)
D = np.diag(np.sum(W, axis=1))
L = D - W
s = np.sum(L, axis=1) / np.trace(L)
S = sparse.diags(s, format='csr')
M = S.dot(L).dot(S)
eigvals, eigvecs = sparse.linalg.eigsh(M, k=self.n_components, which='LM', tol=1e-3, random_state=rng)
V = S.dot(eigvecs)
kmeans = KMeans(n_clusters=self.n_clusters, random_state=rng).fit(V)
self.labels_ = kmeans.labels_
def predict(self, X):
rng = check_random_state(self.random_state)
W = rbf_kernel(X, self.X_, gamma=self.gamma)
D = np.diag(np.sum(W, axis=1))
L = D - W
s = np.sum(L, axis=1) / np.trace(L)
S = sparse.diags(s, format='csr')
M = S.dot(L).dot(S)
eigvals, eigvecs = sparse.linalg.eigsh(M, k=self.n_components, which='LM', tol=1e-3, random_state=rng)
V = S.dot(eigvecs)
return KMeans(n_clusters=self.n_clusters, random_state=rng).fit_predict(V)
在这个代码中,我们使用了rbf_kernel计算高斯核矩阵W,然后计算了度矩阵D和拉普拉斯矩阵L。接着,计算了密度加权的拉普拉斯矩阵M,并使用求解特征值问题的稀疏矩阵算法sparse.linalg.eigsh计算了前n_components个特征向量。接着,使用这些特征向量进行k-means聚类,并将聚类标签存储在self.labels_中。最后,我们还提供了一个predict函数,可以使用之前计算出的特征向量和聚类簇数对新的数据进行聚类。
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