基于Nyström的谱聚类算法
时间: 2024-06-17 15:03:23 浏览: 263
基于Nyström的谱聚类算法是一种常用的谱聚类算法。谱聚类算法是一种基于图论的聚类方法,将数据集看作图中的节点,通过计算相似度矩阵来构建图,并对图进行谱分解,将得到的特征向量作为输入进行聚类。
基于Nyström的谱聚类算法是在谱聚类算法的基础上进行改进的。它通过使用Nyström采样方法来加速矩阵的计算,从而减少计算量和存储空间的消耗。具体来说,该算法先从原始数据集中随机选择一部分数据点作为样本点,然后通过计算样本点之间的相似度来构建相似度矩阵,并对该矩阵进行谱分解。最后,利用得到的特征向量进行聚类。
与传统的谱聚类算法相比,基于Nyström的谱聚类算法具有以下优点:
1. 计算速度更快:采用Nyström采样方法可以大大减少计算量和存储空间的消耗。
2. 可以处理大规模数据集:由于采用了Nyström采样方法,因此该算法可以处理大规模数据集。
3. 聚类效果更好:实验证明,基于Nyström的谱聚类算法在某些情况下可以获得更好的聚类效果。
相关问题
密度加权Nyström谱聚类代码
以下是使用Python实现密度加权Nyström谱聚类的示例代码:
```python
import numpy as np
from sklearn.cluster import KMeans
from sklearn.neighbors import kneighbors_graph
from scipy.sparse.linalg import eigsh
def density_nystrom_spectral_clustering(X, n_clusters, n_components, n_neighbors=10):
# 计算样本间的距离
D = kneighbors_graph(X, n_neighbors=n_neighbors, mode='distance')
D = D.toarray()
# 计算样本的密度
gamma = 1.0 / np.median(D)
rho = np.sum(np.exp(-gamma*D), axis=1)
# 计算密度加权相似度矩阵
A = np.exp(-gamma*D)
for i in range(len(X)):
A[i, :] = A[i, :] / (rho[i] + 1e-10)
A = (A + A.T)/2 # 保证对称性
# 计算Nystrom采样矩阵
m = len(X)
idx = np.random.choice(m, n_components, replace=False)
Z = X[idx]
C = A[:, idx]
W = np.linalg.pinv(C) @ A @ np.linalg.pinv(C.T)
# 计算W的前n_clusters个特征向量
eigval, eigvec = eigsh(W, n_clusters, which='LA')
# 对特征向量进行归一化
Y = eigvec / np.sqrt(np.sum(eigvec**2, axis=1, keepdims=True))
# 使用k-means算法进行聚类
kmeans = KMeans(n_clusters=n_clusters)
kmeans.fit(Y)
labels = kmeans.labels_
return labels
# 生成圆环数据集
X, y = make_circles(n_samples=1000, noise=0.05, factor=0.5)
# 进行密度加权Nyström谱聚类
n_clusters = 2
n_components = 200
n_neighbors = 10
labels = density_nystrom_spectral_clustering(X, n_clusters, n_components, n_neighbors)
# 可视化聚类结果
import matplotlib.pyplot as plt
plt.scatter(X[:, 0], X[:, 1], c=labels, cmap='rainbow')
plt.axis('equal')
plt.show()
```
该代码使用了`sklearn`和`scipy`库提供的函数,可以在运行前先安装这两个库。
首先,使用`make_circles`函数生成圆环数据集,然后调用`density_nystrom_spectral_clustering`函数进行密度加权Nyström谱聚类,最后使用`matplotlib`库可视化聚类结果。
需要注意的是,密度加权Nyström谱聚类需要计算样本间的距离和密度,计算量较大,对于大规模数据集可能会较慢。如果需要加速,可以尝试使用更高效的计算方式,例如使用KD树加速距离计算。
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