infercnv热图

infercnv热图是一种用于可视化单细胞转录组数据的分析工具。它能够根据细胞之间的相似性和差异性将细胞分成不同的群集，并且将每个细胞在基因表达水平上的变化呈现为热图。

对于每个细胞，infercnv会计算其基因表达的Z得分，即标准化的表达值。然后，它会将这些Z得分在细胞与基因之间绘制成矩阵状的图像，其中每个细胞和基因都会有一个对应的行和列。在热图中，细胞可以按照其基因表达的相似性进行聚类，相似的细胞会在热图中被放在一起，形成群集。此外，基因也可以按照其在不同细胞之间的表达水平进行聚类，从而揭示不同基因的表达模式。

infercnv热图的颜色编码通常是根据每个基因在不同细胞中的表达水平来确定的。一般来说，较低的表达值会使用浅色或蓝色来表示，而较高的表达值则使用深色或红色来表示。这种颜色编码方案可以帮助我们快速地观察细胞之间和基因之间的差异。

总之，infercnv热图是一种非常有用的工具，可以帮助研究人员分析单细胞转录组数据，并且直观地展示细胞之间的相似性和差异性，以及基因的表达模式。