samtools 建立 index

Samtools 可以使用以下命令建立索引：

samtools index [options] <input.bam>

其中 `[options]` 是可选参数，`<input.bam>` 是要建立索引的 BAM 文件路径。

常用的选项包括：

- `-b`: 将索引存储为 BAM 索引而不是 SAM 索引。
- `-c`: 将索引存储为 CRAM 索引。
- `-m <INT>`: 设置内存限制（单位为字节），默认为 768M。

例如，要为名为 `example.bam` 的 BAM 文件建立索引，可以使用以下命令：

samtools index example.bam

该命令将在同一目录下生成一个名为 `example.bam.bai` 的索引文件。