python实现DNA翻译
时间: 2023-07-07 13:18:30 浏览: 67
要实现DNA翻译,我们需要将DNA序列转换成RNA序列,再将RNA序列翻译成蛋白质序列。以下是一个简单的Python代码实现。
```python
# DNA翻译
def translate(dna):
# DNA转RNA
rna = dna.replace("T", "U")
# RNA翻译成蛋白质
table = {'UUU': 'F', 'UUC': 'F', 'UUA': 'L', 'UUG': 'L',
'UCU': 'S', 'UCC': 'S', 'UCA': 'S', 'UCG': 'S',
'UAU': 'Y', 'UAC': 'Y', 'UAA': '*', 'UAG': '*',
'UGU': 'C', 'UGC': 'C', 'UGA': '*', 'UGG': 'W',
'CUU': 'L', 'CUC': 'L', 'CUA': 'L', 'CUG': 'L',
'CCU': 'P', 'CCC': 'P', 'CCA': 'P', 'CCG': 'P',
'CAU': 'H', 'CAC': 'H', 'CAA': 'Q', 'CAG': 'Q',
'CGU': 'R', 'CGC': 'R', 'CGA': 'R', 'CGG': 'R',
'AUU': 'I', 'AUC': 'I', 'AUA': 'I', 'AUG': 'M',
'ACU': 'T', 'ACC': 'T', 'ACA': 'T', 'ACG': 'T',
'AAU': 'N', 'AAC': 'N', 'AAA': 'K', 'AAG': 'K',
'AGU': 'S', 'AGC': 'S', 'AGA': 'R', 'AGG': 'R',
'GUU': 'V', 'GUC': 'V', 'GUA': 'V', 'GUG': 'V',
'GCU': 'A', 'GCC': 'A', 'GCA': 'A', 'GCG': 'A',
'GAU': 'D', 'GAC': 'D', 'GAA': 'E', 'GAG': 'E',
'GGU': 'G', 'GGC': 'G', 'GGA': 'G', 'GGG': 'G'}
protein = ""
for i in range(0, len(rna), 3):
codon = rna[i:i+3]
if codon in table:
protein += table[codon]
else:
protein += "-"
return protein
```
在这个代码中,我们定义了一个`translate`函数来实现DNA翻译。首先,将DNA序列中的"T"替换成"U",得到RNA序列。接着,我们定义了一个字典`table`,用于存储每个三个核苷酸的密码子对应的氨基酸。最后,我们将RNA序列按照每三个核苷酸一组进行分割,将每个三个核苷酸的密码子查找对应的氨基酸,并将其添加到蛋白质序列中。如果密码子无法查找到对应的氨基酸,则将一个"-"添加到蛋白质序列中。最终返回翻译得到的蛋白质序列。