seg.nii.gz是什么文件
时间: 2024-04-21 12:24:08 浏览: 256
`.nii.gz` 是一种常见的医学影像文件格式,用于存储三维医学图像数据。它是基于NIfTI(Neuroimaging Informatics Technology Initiative)标准的一种压缩文件格式。
NIfTI是用于神经影像学数据的一种标准格式,可以存储MRI(磁共振成像)和其他类型的医学图像数据。`.nii.gz` 格式是对NIfTI文件进行gzip压缩后得到的文件,可以减少文件大小,方便存储和传输。
`.nii.gz` 文件通常包含三维图像数据和与之相关的元数据,如图像的空间分辨率、坐标系信息等。这种文件格式在医学影像领域被广泛使用,用于存储和处理各种类型的医学图像,如脑部MRI扫描、CT扫描等。
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解释代码ct_path = './volume-0.nii' seg_path = './segmentation-0.nii' ct_array = sitk.GetArrayFromImage(sitk.ReadImage(ct_path)) seg_array = sitk.GetArrayFromImage(sitk.ReadImage(seg_path)) seg_bg = seg_array == 0 seg_liver = seg_array >= 1 seg_tumor = seg_array == 2
这段代码的作用是读取两个医学图像文件,一个是ct图像文件(volumne-0.nii),另一个是分割图像文件(segmentation-0.nii)。然后将读取到的ct图像和分割图像转换为numpy数组(ct_array和seg_array),便于后续的图像处理和分析。接着,将分割图像分为三个部分:背景(seg_bg)、肝脏(seg_liver)和肝癌(seg_tumor),这些部分的像素值分别用0、1和2表示。
将这个双while循环的写法,改成快慢指针或其他更优的方法实现 void FlightStage::UpdateAllDistance2Boundary(vector<MapPoint> &rps) { //rps means reference_points_smoothed if (rps.empty()) return; //separate lines and curves vector<pair<MapPoint, MapPoint>> lines, curves; size_t index = 0; while (index < rps.size() - 1) { pair<MapPoint, MapPoint> seg; seg.first = rps[index]; while (index < rps.size() - 1 && (Equals(seg.first.kappa, rps[index + 1].kappa) || ((isnan(seg.first.kappa) || iszero(seg.first.kappa)) && (isnan(rps[index + 1].kappa) || iszero(rps[index + 1].kappa))))) { seg.second = rps[index + 1]; index++; } if (!isnan(seg.first.s) && !isnan(seg.second.s)) { seg.second = rps[index];//lines and curves are unconnected seg.first.point_enu.z = 0.0; seg.second.point_enu.z = 0.0; (isnan(seg.first.kappa) || iszero(seg.first.kappa)) ? lines.emplace_back(seg) : curves.emplace_back(seg); } index++; }}
可以将双while循环改写为单while循环和双指针的方式来实现。首先,我们可以使用一个指针fast和一个指针slow,初始时都指向rps的第一个元素。然后,我们可以使用一个变量prevKappa来存储上一个元素的kappa值。
以下是改写后的代码示例:
```cpp
void FlightStage::UpdateAllDistance2Boundary(vector<MapPoint> &rps) {
if (rps.empty()) return;
vector<pair<MapPoint, MapPoint>> lines, curves;
size_t slow = 0;
size_t fast = 0;
double prevKappa = rps[0].kappa;
while (fast < rps.size()) {
if (Equals(rps[fast].kappa, prevKappa) ||
((isnan(prevKappa) || iszero(prevKappa)) &&
(isnan(rps[fast].kappa) || iszero(rps[fast].kappa)))) {
fast++;
} else {
pair<MapPoint, MapPoint> seg;
seg.first = rps[slow];
seg.second = rps[fast - 1];
if (!isnan(seg.first.s) && !isnan(seg.second.s)) {
seg.first.point_enu.z = 0.0;
seg.second.point_enu.z = 0.0;
(isnan(seg.first.kappa) || iszero(seg.first.kappa)) ?
lines.emplace_back(seg) : curves.emplace_back(seg);
}
slow = fast;
prevKappa = rps[fast].kappa;
}
}
// Handle the last segment
if (slow < rps.size()) {
pair<MapPoint, MapPoint> seg;
seg.first = rps[slow];
seg.second = rps[rps.size() - 1];
if (!isnan(seg.first.s) && !isnan(seg.second.s)) {
seg.first.point_enu.z = 0.0;
seg.second.point_enu.z = 0.0;
(isnan(seg.first.kappa) || iszero(seg.first.kappa)) ?
lines.emplace_back(seg) : curves.emplace_back(seg);
}
}
}
```
这样,我们通过使用双指针来遍历rps,只需要一次遍历就可以得到lines和curves,避免了双while循环的使用。
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