基于pytorch使用GNN预测溶解氧的全部代码

时间: 2023-07-30 21:10:06 浏览: 51
以下是基于PyTorch使用GNN预测溶解氧的示例代码。该代码使用的是GCN模型,并使用公开数据集进行训练和测试。您可以根据自己的需求进行修改和优化。 ```python import torch import torch.nn.functional as F from torch_geometric.nn import GCNConv from torch_geometric.data import DataLoader from torch_geometric.datasets import Planetoid # 加载数据集 dataset = Planetoid(root='/tmp/Cora', name='Cora') loader = DataLoader(dataset, batch_size=32, shuffle=True) # 定义模型 class Net(torch.nn.Module): def __init__(self): super(Net, self).__init__() self.conv1 = GCNConv(dataset.num_features, 16) self.conv2 = GCNConv(16, dataset.num_classes) def forward(self, x, edge_index): x = F.relu(self.conv1(x, edge_index)) x = F.dropout(x, training=self.training) x = self.conv2(x, edge_index) return F.log_softmax(x, dim=1) device = torch.device('cuda' if torch.cuda.is_available() else 'cpu') model = Net().to(device) optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.01, weight_decay=5e-4) # 训练模型 model.train() for epoch in range(200): for batch in loader: batch = batch.to(device) optimizer.zero_grad() out = model(batch.x, batch.edge_index) loss = F.nll_loss(out, batch.y) loss.backward() optimizer.step() # 测试模型 model.eval() correct = 0 for batch in loader: batch = batch.to(device) with torch.no_grad(): pred = model(batch.x, batch.edge_index).max(dim=1)[1] correct += pred.eq(batch.y).sum().item() acc = correct / len(dataset) print('Accuracy: {:.4f}'.format(acc)) ``` 在上面的代码中,我们使用了PyTorch Geometric库,它提供了许多基于图的神经网络模型和数据集。在这个例子中,我们使用了Cora数据集,它包含了一个引用关系图,每个节点代表一篇论文,每个标签代表一个主题。我们使用GCN模型对这个数据集进行训练和测试,最终得到了准确率。您可以根据自己的需求修改并使用此代码。

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