用Pytorch写SDNE代码,要求使用ARXIV GR-QC数据集。

时间: 2023-05-24 14:02:03 浏览: 62
好的,我会尽力回答你的问题。 SDNE (Structural Deep Network Embedding) 是一种用于将网络结构映射到低维空间的方法。这种方法通常用于网络可视化、网络社区发现、网络分类等任务。 使用 Pytorch 实现 SDNE 的步骤如下: 1. 准备数据。首先,你需要准备好你要使用的网络数据集。在本例中,你需要使用 ARXIV GR-QC 数据集。这个数据集包含了一个论文的引用网络,其中点表示论文,边表示论文之间的引用关系。你需要将这个网络的邻接矩阵存储到一个矩阵中,并将这个矩阵转换为 Pytorch 的 Tensor。 2. 定义模型。接下来,你需要定义一个 Pytorch 模型来实现 SDNE。这个模型应该包含两个部分:一个编码器和一个解码器。编码器将原始网络数据映射到低维空间,解码器则将低维空间中的数据还原成原始网络。你需要使用 Pytorch 的 nn.Module 类来定义这个模型。 3. 定义损失函数和优化器。接下来,你需要定义损失函数和优化器来训练
相关问题

用Pytorch写SDNE代码,要求使用ARXIV GR-QC数据集,给出代码和注释即可,其他无需多言。

在开始之前,需要先导入所需的库和设置超参数: ``` import torch import numpy as np import networkx as nx # 超参数设置 hidden_size = 32 # 隐藏层大小 learning_rate = 0.01 # 学习率 num_epochs = 10 # 训练轮数 ``` 接下来,我们需要加载GR-QC数据集。这可以通过使用networkx库的`read_edgelist`函数来完成。 ``` # 加载GR-QC数据集 G = nx.read_edgelist('grqc.txt') # 获取图中的节点数和边数 num_nodes = G.number_of_nodes() num_edges = G.number_of_edges() # 创建邻接矩阵 adj_matrix = nx.adjacency_matrix(G).todense() ``` 接下来,我们需要定义SDNE模型的网络结构。这可以通过定义一个带有两个隐藏层的多层感知机来实现。 ``` class SDNE(torch.nn.Module): def __init__(self, num_nodes, hidden_size): super(SDNE, self).__init__() self.encoder = torch.nn.Sequential( torch.nn.Linear(num_nodes, hidden_size), torch.nn.ReLU(), torch.nn.Linear(hidden_size, int(hidden_size / 2)), torch.nn.ReLU() ) self.decoder = torch.nn.Sequential( torch.nn.Linear(int(hidden_size / 2), hidden_size), torch.nn.ReLU(), torch.nn.Linear(hidden_size, num_nodes), torch.nn.Sigmoid() ) def forward(self, x): x = self.encoder(x) x = self.decoder(x) return x ``` 接下来,我们可以定义损失函数和优化器。对于SDNE模型,我们通

用Pytorch写SDNE代码,要求使用ARXIV GR-QC数据集和原论文方法,给出代码和注释即可,其他无需多言。

好的,我会尽力给出一份使用 Pytorch 实现 SDNE 的代码。 首先,需要安装 Pytorch 和相关的依赖包,具体安装方式可以参考 Pytorch 的官方文档。 然后,需要准备好 ARXIV GR-QC 数据集。这个数据集是一个有向图,其中节点表示论文,边表示论文之间的引用关系。数据集包含两个文件: - `citation_network.edges`:包含有向图的边的列表,每行表示一条边,包含两个整数,分别表示边的起点和终点。 - `feature_vectors.features`:包含每个节点的特征向量的列表,每行表示一个节点的特征向量,是一个浮点数列表。 我们可以使用下面的代码来读取这两个文件: ```python import numpy as np def load_data(edge_file, feature_file): # 读取边的列表 edges = [] with open(edge_file, 'r') as f: for line in f: u, v = map(int, line.strip().split()) edges.append((u, v)) # 读取节点的特征向量 features = [] with open(feature_file, 'r') as f: for line in f: feature = list(map(float, line.strip().split())) features.append(feature) # 将边和特征转换为 numpy 数组 edges = np.array(edges, dtype=np.int64) features = np.array(features, dtype=np.float32) return edges, features ``` 接下来,我们需要实现 SDNE 模型。

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