annotation = wfdb.rdann('mit-bih-arrhythmia-database-1.0.0/' + number, 'atr') Rlocation = annotation.sample Rclasses = annotation.symbol annotation.symbol = [Rclass.replace("+", "K") for Rclass in Rclasses] print(annotation.symbol)这段代码是什么意思
时间: 2024-03-07 07:52:24 浏览: 182
这段代码是针对MIT-BIH心律失常数据库中的某个记录(由变量number指定)进行标注文件读取和处理的过程。具体实现如下:
- 函数调用`wfdb.rdann()`读取指定记录的标注文件,其中第一个参数是记录的文件名,第二个参数是标注类型(在这里是'atr',代表R峰的位置和类型)。
- 将所有R峰的位置(即样本位置)存储在Rlocation列表中,将所有R峰的类型(即标记符号)存储在Rclasses列表中。
- 使用列表推导式将所有R峰的类型中的加号(+)替换成大写字母K,并将替换后的符号列表存储在annotation.symbol中。
- 最后打印出替换后的标记符号列表。
因此,这段代码的作用是读取MIT-BIH心律失常数据库中指定记录的标注文件,获取该记录中所有R峰的位置和类型,并对标记符号进行处理,将加号替换成大写字母K,并输出替换后的标记符号列表。
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all_signals, fields = wfdb.rdsamp(os.path.join(data_path, record)) annotations = wfdb.rdann(os.path.join(data_path, record), 'atr')解释一下
这段代码是使用 WFDB 库对心电信号数据进行读取和解析的过程。
`wfdb.rdsamp()` 函数用于读取心电信号数据,其中 `os.path.join(data_path, record)` 是心电信号数据的路径和文件名。该函数返回两个值,`all_signals` 是一个二维数组,包含了所有导联的信号数据,`fields` 是一个字典,包含了数据的相关信息,如采样率、导联名称等。
`wfdb.rdann()` 函数用于读取相应的注释文件,其中 `os.path.join(data_path, record)` 是心电信号数据的路径和文件名, `'atr'` 表示使用标准的 MIT-BIH 格式的注释文件。该函数返回一个 `Annotation` 对象,包含了注释的相关信息,如每个心拍的类型和位置等。
用wfdb库读取mit-bih心电信号数据集提取幅值数据和标签数据,用biosppy库分析信号并剪切心拍并标记对应标签,再把每一个心拍归一化生成256*256单色位图关联标签并保存且可视化,python代码
以下是使用wfdb和biosppy库读取MIT-BIH心电信号数据集,提取幅值数据和标签数据,并使用opencv库生成归一化的单色位图关联标签的Python代码。请注意,该代码仅适用于二类分类任务,即正常心跳和异常心跳。
```python
import wfdb
import biosppy
import cv2
import numpy as np
# 读取MIT-BIH心电信号数据集
record = wfdb.rdrecord('mit-bih-arrhythmia-database-1.0.0/100', sampto=5000)
annotation = wfdb.rdann('mit-bih-arrhythmia-database-1.0.0/100', 'atr', sampto=5000)
# 提取幅值数据和标签数据
signals = record.p_signal[:, 0]
labels = annotation.symbol
# 分析信号并剪切心拍并标记对应标签
out = biosppy.signals.ecg.ecg(signal=signals, show=False)
rpeaks = out['rpeaks']
beat_samples = biosppy.signals.ecg.christov_segmenter(signal=signals, rpeaks=rpeaks)[0]
beat_labels = [labels[np.where(annotation.sample == rpeak)[0][0]] for rpeak in rpeaks]
# 归一化并生成256*256单色位图关联标签
for i, beat_sample in enumerate(beat_samples):
beat = signals[beat_sample[0]:beat_sample[-1]]
beat = cv2.resize(beat, (256, 256))
beat = np.uint8((beat - np.min(beat)) / (np.max(beat) - np.min(beat)) * 255)
label = beat_labels[i]
cv2.imwrite(f'{label}_{i}.png', beat)
```
该代码首先使用wfdb库读取MIT-BIH心电信号数据集中的一个样本,并使用biosppy库分析信号并剪切心拍并标记对应标签。然后,使用opencv库将每个心拍归一化为256*256单色位图,并将其与其对应的标签保存为文件。请注意,此代码仅处理前5000个样本,您可以更改“sampto”参数以处理整个数据集。
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