物种间基因家族共线性circos

基于引用\[2\]和\[3\]的内容，物种间基因家族共线性可以通过使用MCScanX软件进行分析。在这个过程中，首先需要对不同物种的基因组进行注释，并将比对结果整合成一组文件。然后，利用MCScanX进行共线性分析，寻找基因组间的共线性区段。MCScanX会根据染色体号的前缀将染色体划分为不同的物种，并生成共线性区块。这些共线性区块可以通过circos图来展示物种间的基因家族共线性关系。因此，通过使用MCScanX和circos图，可以研究物种间基因家族的共线性。
#### 引用[.reference_title]
- *1* [linux统计单拷贝基因家族,为什么要进行基因家族分析？](https://blog.csdn.net/weixin_36075067/article/details/116915395)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^control_2,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item]
- *2* *3* [利用 DIAMOND、MCScanX、TBtools 分析物种基因组间的共线性区段与基因复制事件](https://blog.csdn.net/sinat_41621566/article/details/113359074)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^control_2,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item]
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