enrichplot
时间: 2023-11-26 18:47:19 浏览: 102
骨肉瘤基因表达谱芯片的生物信息学分析.pdf
enrichplot是一个R语言包,用于可视化功能富集分析结果。它提供了多种绘图类型,包括dotplot、barplot、cnetplot等,可以帮助用户更好地理解功能富集分析结果。其中,dotplot是最常用的一种绘图类型,它可以将富集分析结果中的通路或基因集按照P值或FDR值进行排序,并将它们以点的形式展示在图中。同时,还可以根据用户的需求对图形进行自定义调整,例如修改点的大小、颜色、标签等。除了dotplot之外,enrichplot还提供了其他多种绘图类型,可以根据用户的需求进行选择。
以下是一个简单的dotplot绘图示例:
```R
library(enrichplot)
data(geneList)
data(geneListID)
data(geneListID2GOBP)
dotplot(geneListID2GOBP, showCategory=20)
```
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