基因共表达网络代码有吗

是的，有很多开源的工具和软件包可以用于构建基因共表达网络，并且提供相应的代码和实现。以下是一些常用的工具和软件包：

1. WGCNA（Weighted Gene Co-expression Network Analysis）：WGCNA是R语言中非常流行的基因共表达网络分析工具。它提供了一系列的函数和工具，可以进行基因表达数据的预处理、共表达网络的构建、模块发现和功能富集分析等。你可以在CRAN（https://cran.r-project.org/web/packages/WGCNA/index.html）上找到该软件包的代码和文档。

2. CoExpNetViz：这是一个基于Java的基因共表达网络可视化工具，可以用于构建和可视化共表达网络。你可以在GitHub（https://github.com/idekerlab/CoExpNetViz）上找到该工具的代码和使用说明。

3. cytoscape：Cytoscape是一个功能强大的网络可视化和分析工具，可以用于构建和分析基因共表达网络。它支持多种数据格式和算法，并提供了丰富的插件和扩展功能。你可以在官方网站（https://cytoscape.org/）上找到Cytoscape的下载和使用信息。

除了以上提到的工具，还有很多其他的基因共表达网络分析工具可供选择，如CORNET（https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/cornet.html）、GENIE3（http://www.montefiore.ulg.ac.be/~huynh-thu/GENIE3.html）等。你可以根据自己的需求和具体的数据类型选择合适的工具和软件包进行分析。