DICOM格式和NIFTI格式的医学图像如何转换?
时间: 2024-10-27 07:15:38 浏览: 168
医学图像格式转化软件(dicom转nifti)
DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine) 和 NIFTI (Neuroimaging Informatics Technology Initiative) 是两种常见的医学成像文件格式,用于存储和传输医学图像。将DICOM转换为NIFTI格式,一般需要用到专门的医学图像处理库,比如`pydicom`(用于读取DICOM)和`nibabel`(用于写入NIFTI)。
以下是基本的转换步骤:
1. **安装所需库**:
```bash
pip install pydicom nibabel
```
2. **读取DICOM文件**:
```python
from pydicom import dcmread
dicom_series = dcmread('path_to_your_dicom_folder')
```
3. **提取并组织数据**:
```python
img_array = dicom_series.pixel_array
metadata = dicom_series.file_meta
```
4. **创建NIFTI Image对象**:
```python
import nibabel as nib
nifti_image = nib.Nifti1Image(img_array, dicom_series.ImagePositionPatient)
```
5. **添加元数据**(如果必要):
```python
header = dicom_series.dir
nifti_image.set_header(header)
```
6. **保存NIFTI文件**:
```python
nib.save(nifti_image, 'output_filename.nii')
```
注意,这只是一个简单的示例,实际转换过程可能会更复杂,特别是当涉及到空间定位、方向和其他元数据时。如果源DICOM系列包含多个平面或者序列,你可能还需要处理这些信息。
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