请修改上述代码,我有多个基因树,请遍历每一个基因树完成排序
时间: 2024-04-12 14:31:26 浏览: 97
好的,我已经修改了代码,使其能够遍历每个基因树并完成排序。请查看下面的代码:
```python
def reorder_gene_tree(gene_tree, species_tree):
# 获取物种树的分支顺序
species_order = get_species_order(species_tree)
# 根据物种树的分支顺序重排基因树
reordered_tree = []
for species in species_order:
for branch in gene_tree:
if branch['species'] == species:
reordered_tree.append(branch)
break
return reordered_tree
def get_species_order(species_tree):
# 在此处实现获取物种树分支顺序的代码逻辑
pass
# 示例数据
gene_trees = [
[{'species': 'A'}, {'species': 'B'}, {'species': 'C'}, {'species': 'D'}],
[{'species': 'D'}, {'species': 'C'}, {'species': 'B'}, {'species': 'A'}],
# 添加更多基因树...
]
species_tree = ['C', 'A', 'D', 'B']
# 遍历每个基因树并重排分支顺序
for gene_tree in gene_trees:
reordered_gene_tree = reorder_gene_tree(gene_tree, species_tree)
print(reordered_gene_tree)
```
在这个修改后的代码中,我们假设你有一个包含多个基因树的列表 `gene_trees`。我们遍历每个基因树,并对其进行排序。在这个示例中,我们只打印了每个排序后的基因树结果,你可以根据实际需要进行相应的处理。
请确保将实际的基因树数据替换到 `gene_trees` 列表中,并根据需要修改 `species_tree`。
希望这次的修改满足了你的需求!如果还有其他问题,请随时提问。
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