gnn图神经网络前置数据处理代码
时间: 2024-11-22 18:29:42 浏览: 6
gnn图神经网络(代码完整)
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图神经网络 (Graph Neural Networks, GNN) 的前置数据处理通常涉及到以下几个关键步骤:
1. **构建图结构**:首先,你需要将数据转换成图的形式。这包括节点 (nodes)、边 (edges) 和可能的节点属性 (node features) 或边属性 (edge features)。例如,在社交网络中,用户可以是节点,他们的联系则是边。
```python
import networkx as nx
# 创建图
G = nx.Graph()
G.add_nodes_from(users, attributes=dict(age, gender)) # 添加节点及属性
G.add_edges_from(followers, weight='strength') # 添加边及其权重
```
2. **编码节点特征**:如果节点有额外的数据,如用户的标签或描述,需要将其转换为数值向量。常见的做法是使用嵌入技术(如Word2Vec或GloVe),或者通过预训练模型获取。
```python
from gensim.models import Word2Vec
node_embeddings = Word2Vec(nodes_descriptions)
G.node[node_id] = node_embeddings[node_id]
```
3. **邻接矩阵或邻居采样**:为了计算每个节点的信息,GNN通常会利用邻接矩阵表示图的结构。此外,邻居采样(如ego-networks或随机游走)也是常用的技术,用于限制信息传播到节点的近邻范围。
```python
adj_matrix = nx.adjacency_matrix(G).todense() # 转换为邻接矩阵
sampled_neighbors = G.neighbors(node_id)[:num_samples] # 邻居采样
```
4. **标签和分割**:如果你的目标是监督学习,那么需要准备标签数据。同时,可能还需要对节点或图进行分层(如社区检测),以便于训练过程。
```python
labels = [get_label(node) for node in nodes] # 获取节点标签
train_test_split(G, labels) # 分割为训练集和测试集
```
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