影像组学全流程 R语言
时间: 2023-09-30 22:07:42 浏览: 277
完整影像组学分析流程 多重插值补缺-特征挑选-聚类-回归-ROC-Crossvalidation-DCA-收工
影像组学全流程是指利用影像学数据进行特征提取、建模和预测的过程。在R语言中,可以使用RStudio这个集成开发环境来完成影像组学的全流程分析。
首先,确保你已经安装了R和RStudio。RStudio是一个美观、人性化的窗口,提供了方便的操作和调试功能,支持纯R脚本、Rmarkdown、Bookdown和Shiny等多种方式。
接下来,你可以参考引用\[1\]中提供的论文《Development and validation of an MRI-based radiomics nomogram for distinguishing Warthin’s tumour from pleomorphic adenomas of the parotid gland》的方法进行复现。你可以在RStudio中使用RMarkdown来运行完整的代码。
在运行之前,你需要先下载glioma.7z压缩包,并将其解压缩。然后,你可以在RStudio中创建一个新的RMarkdown文件,将代码复制到文件中,并按照代码中的指示进行操作。代码中包括了对临床和影像组学特征进行建模,并绘制Lasso回归图、ROC曲线、诺模图、校准曲线和决策曲线等。
总之,使用RStudio的RMarkdown可以帮助你完成影像组学全流程的分析,包括特征提取、建模和可视化等步骤。R语言作为一门统计计算语言,提供了丰富的函数和包,可以满足影像组学分析的需求。
#### 引用[.reference_title]
- *1* [实现影像组学全流程](https://blog.csdn.net/weixin_42990106/article/details/122102397)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^insertT0,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item]
- *2* *3* [【影像组学导论】Radiomics实现之R语言入门!](https://blog.csdn.net/weixin_40166430/article/details/119812123)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^insertT0,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item]
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