R语言readGWASdata
时间: 2024-01-04 08:03:26 浏览: 31
readGWASdata是一个R语言包,用于读取和处理GWAS(基因组关联研究)数据。它可以读取多种格式的数据文件,包括PLINK格式、VCF格式、BGEN格式等。使用readGWASdata包可以方便地进行数据预处理、质量控制、基因型和表型数据的合并等操作。
以下是使用readGWASdata包读取PLINK格式数据的示例代码:
```R
# 安装readGWASdata包
install.packages("readGWASdata")
# 加载readGWASdata包
library(readGWASdata)
# 读取PLINK格式数据
data <- read_plink("data.bed", "data.bim", "data.fam")
```
其中,read_plink函数的三个参数分别为PLINK格式数据的三个文件:bed文件、bim文件和fam文件。读取后的数据将保存在data变量中。
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