kld_criterion = lambda x, y, mu, logvar: reconstruction_loss(y, x, reduction="sum") + kld_loss(mu, logvar, beta=0.1)

时间: 2024-03-18 09:43:08 浏览: 7
这段代码定义了一个损失函数,其中包含了重构误差和KL散度损失。具体来说,该损失函数可表示为: L = reconstruction_loss(y, x, reduction="sum") + kld_loss(mu, logvar, beta=0.1) 其中,y和x分别表示输入和重构后的输出,mu和logvar分别表示编码器输出的均值和方差,reconstruction_loss表示重构误差的损失函数,kld_loss表示KL散度的损失函数,beta=0.1表示KL散度的权重系数。 重构误差是指重构后的输出与输入之间的差异,通常使用均方误差或交叉熵等损失函数来度量。KL散度是一种用于衡量两个概率分布之间差异的指标,用于衡量编码器输出的分布与标准正态分布之间的差异。通过将重构误差和KL散度结合起来,可以在保证重构精度的同时,尽可能地使编码器输出的分布接近标准正态分布,从而实现更好的数据压缩和泛化能力。
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L = reconstruction_loss(y, x, reduction="sum") + kld_loss(mu, logvar, beta=0.1)中的reduction="sum"是什么意思,reconstruction_loss是nn.functional.mse_loss

在L = reconstruction_loss(y, x, reduction="sum") + kld_loss(mu, logvar, beta=0.1)中,reduction="sum"表示计算重构误差时,将所有样本的误差求和。在PyTorch中,reconstruction_loss使用的是nn.functional.mse_loss,即均方误差损失函数,其计算公式为: loss(x, y) = 1/n * sum((x_i - y_i)^2) 其中,x和y分别表示重构后的输出和输入,n表示样本数量。 通过设置reduction="sum",表示对所有样本的损失进行求和,从而得到整个batch的损失。与之相对的是reduction="mean",表示对所有样本的损失进行求平均,即: loss = 1/n * sum(loss(x_i, y_i)) 其中,loss(x_i, y_i)表示单个样本的损失。

你现在利用pytorch定义了两个神经网络,一个是3层用全连接层构造成的MLP,还有一个是图注意力网络。两个输出均是(16,307,12)。你现在需要把这两个神经网络作为VAE的两个编码器,将它们的输出拼接后计算隐变量,然后解码生成新的交通数据集。这个pytorch应该怎么写,请给我一个比较完整的pytorch代码。原来的数据集形状为(16992,307,12,3)的数据集,其中,16992是时间段数,307是传感器节点个数,12是历史步长,3是特征维度。第一个特征维度是速度,第二个特征维度是根据邻接矩阵产生的度特征,第三个特征维度是星期。现在按照batch_size=16送入模型得到的输出均是(16,307,12),并最好告诉我每一行在做什么,相应输出维度应该是什么。两个class均不想删除,那decoder怎么写,两个输入参数是不一样的,例如MLP的相关参数是input_dim = 36,hidden_dim = 64,output_dim = 12,history_length=12,GAT的相关参数是num_heads = 8,in_dim = 3,hidden_dim = 64,out_dim = 36,输出维度是相同的。最后,请随机生成形状为(16992,307,12,3)的数据集,按批次送入模型,让我自行看看模型的效果

好的,以下是一个比较完整的PyTorch代码,实现了VAE的编码器和解码器部分,其中编码器部分使用了两个神经网络,分别是MLP和GAT网络: ```python import torch import torch.nn as nn import torch.nn.functional as F from torch.autograd import Variable from torch.utils.data import Dataset, DataLoader # 定义MLP网络 class MLP(nn.Module): def __init__(self, input_dim, hidden_dim, output_dim, history_length): super(MLP, self).__init__() self.fc1 = nn.Linear(input_dim * history_length, hidden_dim) self.fc21 = nn.Linear(hidden_dim, output_dim) self.fc22 = nn.Linear(hidden_dim, output_dim) def encode(self, x): x = x.view(x.size(0), -1) h1 = F.relu(self.fc1(x)) return self.fc21(h1), self.fc22(h1) def forward(self, x): mu, logvar = self.encode(x) std = torch.exp(0.5 * logvar) eps = torch.randn_like(std) return eps.mul(std).add_(mu), mu, logvar # 定义GAT网络 class GAT(nn.Module): def __init__(self, num_heads, in_dim, hidden_dim, out_dim): super(GAT, self).__init__() self.num_heads = num_heads self.fc = nn.Linear(in_dim, hidden_dim) self.attn_fc = nn.Linear(hidden_dim, num_heads * out_dim) def forward(self, x, adj): x = self.fc(x) N = x.size()[1] x = x.view(-1, N, self.num_heads, int(x.size()[2] / self.num_heads)) x = x.permute(0, 2, 1, 3) a = self.attn_fc(x) a = a.view(-1, self.num_heads, N, N) attn = F.softmax(a, dim=-1) h = torch.matmul(attn, x) h = h.permute(0, 2, 1, 3).contiguous() h = h.view(-1, N, int(x.size()[2])) return h # 定义VAE模型 class VAE(nn.Module): def __init__(self, mlp_input_dim, mlp_hidden_dim, mlp_output_dim, mlp_history_length, gat_num_heads, gat_in_dim, gat_hidden_dim, gat_out_dim): super(VAE, self).__init__() self.mlp = MLP(mlp_input_dim, mlp_hidden_dim, mlp_output_dim, mlp_history_length) self.gat = GAT(gat_num_heads, gat_in_dim, gat_hidden_dim, gat_out_dim) self.fc1 = nn.Linear(mlp_output_dim + gat_out_dim, 256) self.fc2 = nn.Linear(256, 307 * 12 * 3) def decode(self, z): h = F.relu(self.fc1(z)) return torch.sigmoid(self.fc2(h)) def forward(self, x, adj): z, mu, logvar = self.mlp(x) gat_out = self.gat(x, adj) z = torch.cat([z, gat_out], dim=-1) return self.decode(z), mu, logvar # 定义数据集 class RandomDataset(Dataset): def __init__(self, shape): self.shape = shape def __getitem__(self, index): return torch.randn(self.shape), torch.randn(self.shape) def __len__(self): return 1000 # 随机生成数据集 dataset = RandomDataset((16, 307, 12, 3)) dataloader = DataLoader(dataset, batch_size=16, shuffle=True) # 初始化模型 mlp_input_dim = 36 mlp_hidden_dim = 64 mlp_output_dim = 12 mlp_history_length = 12 gat_num_heads = 8 gat_in_dim = 3 gat_hidden_dim = 64 gat_out_dim = 36 vae = VAE(mlp_input_dim, mlp_hidden_dim, mlp_output_dim, mlp_history_length, gat_num_heads, gat_in_dim, gat_hidden_dim, gat_out_dim) # 训练模型 optimizer = torch.optim.Adam(vae.parameters(), lr=1e-4) def loss_function(recon_x, x, mu, logvar): BCE = F.binary_cross_entropy(recon_x, x.view(-1, 307 * 12 * 3), reduction='sum') KLD = -0.5 * torch.sum(1 + logvar - mu.pow(2) - logvar.exp()) return BCE + KLD num_epochs = 10 for epoch in range(num_epochs): for i, data in enumerate(dataloader): x, adj = data optimizer.zero_grad() recon_x, mu, logvar = vae(x, adj) loss = loss_function(recon_x, x, mu, logvar) loss.backward() optimizer.step() if i % 10 == 0: print('Epoch [%d/%d], Step [%d/%d], Loss: %.4f' % (epoch+1, num_epochs, i+1, len(dataset)//16, loss.item())) # 测试模型 test_data = torch.randn(16992, 307, 12, 3) test_adj = torch.randn(16992, 307, 307) test_result = [] batch_size = 16 num_batches = test_data.shape[0] // batch_size for i in range(num_batches): x = test_data[i*batch_size:(i+1)*batch_size] adj = test_adj[i*batch_size:(i+1)*batch_size] recon_x, _, _ = vae(x, adj) test_result.append(recon_x.detach().numpy()) test_result = np.concatenate(test_result, axis=0) print(test_result.shape) ``` 在上面的代码中,MLP是一个包含三个全连接层的神经网络,GAT是一个基于图注意力机制的神经网络。VAE模型将这两个神经网络作为两个编码器,将它们的输出拼接后计算隐变量,然后解码生成新的交通数据集。输入数据集的形状为(16992,307,12,3),其中,16992是时间段数,307是传感器节点个数,12是历史步长,3是特征维度。第一个特征维度是速度,第二个特征维度是根据邻接矩阵产生的度特征,第三个特征维度是星期。按批次送入模型时,每个batch的大小为16。 在训练过程中,我们使用了随机生成的数据集进行训练,并且使用Adam优化器进行优化。在测试过程中,我们随机生成了一组符合原始数据集形状的数据集,并按批次送入模型生成新的交通数据集。

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