Illegal access: this web application instance has been stopped already. Could not load com.mysql.jdbc.Driver.

这个错误提示表明在web应用程序停止后，尝试加载com.mysql.jdbc.Driver时发生了非法访问。这可能是由于未正确注销JDBC驱动程序导致的内存泄漏。为了解决这个问题，你可以按照以下步骤进行操作：

1. 确保在web应用程序停止时注销JDBC驱动程序。你可以在web应用程序的关闭钩子中添加代码来注销驱动程序。例如，在Servlet中，你可以在`destroy()`方法中添加以下代码：

@Override
public void destroy() {
    try {
        Enumeration<Driver> drivers = DriverManager.getDrivers();
        while (drivers.hasMoreElements()) {
            Driver driver = drivers.nextElement();
            if (driver.getClass().getClassLoader() == getClass().getClassLoader()) {
                DriverManager.deregisterDriver(driver);
            }
        }
    } catch (SQLException e) {
        e.printStackTrace();
    }
}

2. 确保你的应用程序使用的是正确的MySQL驱动程序。你可以尝试更新或重新配置MySQL驱动程序，确保它与你的应用程序兼容。

3. 检查你的应用程序的类路径是否正确配置。确保你的应用程序可以找到并加载所需的驱动程序类。

4. 如果你使用的是Tomcat服务器，你还可以尝试在`context.xml`文件中添加`antiResourceLocking="true"`属性，以防止资源锁定问题。

请注意，这只是一些可能的解决方案之一，具体的解决方法可能因你的应用程序和环境而异。