用python将ct数据批量从512*512转变为256*256
时间: 2023-11-18 20:06:38 浏览: 63
可以使用Python中的SimpleITK库来实现这个功能。以下是实现的步骤:
1. 导入SimpleITK库
```python
import SimpleITK as sitk
```
2. 设置输入和输出路径
```python
input_path = "path/to/input/folder"
output_path = "path/to/output/folder"
```
3. 循环遍历输入文件夹中的所有文件,并进行转换
```python
for file_name in os.listdir(input_path):
# 读取输入文件
input_file_path = os.path.join(input_path, file_name)
input_image = sitk.ReadImage(input_file_path)
# 设置输出文件的参数
output_origin = input_image.GetOrigin()
output_spacing = [s*2 for s in input_image.GetSpacing()]
output_size = [int(sz/2) for sz in input_image.GetSize()]
output_direction = input_image.GetDirection()
# 进行重采样
output_image = sitk.Resample(input_image, output_size, sitk.Transform(), sitk.sitkLinear, output_origin, output_spacing, output_direction, 0.0, input_image.GetPixelID())
# 保存输出文件
output_file_name = file_name.replace(".nii.gz", "_resampled.nii.gz")
output_file_path = os.path.join(output_path, output_file_name)
sitk.WriteImage(output_image, output_file_path)
```
在上面的代码中,我们首先使用sitk.ReadImage()方法读取每个输入文件。然后使用输入图像的参数来设置输出图像的参数,包括原点、间距、大小和方向。接下来,我们使用sitk.Resample()方法将输入图像重采样为256x256大小的图像。最后,我们使用sitk.WriteImage()方法将输出图像保存到输出文件夹中。
注意:上面的代码仅适用于输入图像的像素大小为2的幂次方,即512x512。如果输入图像的大小不是2的幂次方,需要根据具体情况进行调整。