pythondf2新增一列“gene”其值为“Gene Symbol”列的第一个基因名,df1的“ID_REF”列重命名为“ID”列,df2保留“ID”和“gene”列然后与df1合并为df,df中gene名相同的记录表达量取平均值,打印df
时间: 2023-10-02 18:03:24 浏览: 41
好的,您可以使用 Pandas 提供的函数 `assign()` 和 `rename()` 来新增一列和重命名列名,使用 `merge()` 函数来合并两个 DataFrame,并使用 `groupby()` 函数和 `mean()` 函数来计算平均值。具体的代码如下:
```python
# 新增一列 gene,其值为 Gene Symbol 列的第一个基因名
df2 = df2.assign(gene=df2['Gene Symbol'].str.split(' /// ').str[0])
# 重命名 df1 中的 ID_REF 列为 ID 列
df1 = df1.rename(columns={'ID_REF': 'ID'})
# 保留 df2 中的 ID 和 gene 列,然后与 df1 合并为 df
df = pd.merge(df1, df2[['ID', 'gene']], on='ID')
# 根据 gene 列分组,并计算表达量的平均值
df = df.groupby('gene').mean()
# 打印 df
print(df)
```
其中,`assign()` 函数用于新增一列,`str.split()` 函数用于将 Gene Symbol 列的多个基因名分开,并使用 `str[0]` 取第一个基因名。`rename()` 函数用于重命名列名,`merge()` 函数用于合并两个 DataFrame,`groupby()` 函数用于按照 gene 列分组,`mean()` 函数用于计算平均值。最后使用 `print()` 函数打印 df。