mne-python处理fnirs
时间: 2023-10-18 13:04:07 浏览: 261
mne-python是一个用于处理脑电图(EEG)和磁共振成像(MRI)数据的Python库,不支持直接处理fNIRS数据。但是,可以使用mne-nirs扩展来处理fNIRS数据。mne-nirs是mne-python的一个扩展,用于处理光学脑成像(fNIRS)数据。
使用mne-nirs,你可以读取、预处理和分析fNIRS数据。这个库提供了许多处理fNIRS数据的功能,如光程校正、信号质量评估、通道选择、参考选择、基线校正、时间对齐、心理学指标计算等等。
以下是一个简单的使用mne-nirs处理fNIRS数据的示例:
```python
import mne
import mne_nirs
# 读取fNIRS数据
raw = mne.io.read_raw_nirx('my_data.nirs')
# 选择通道
raw = raw.pick(picks='hbo')
# 光程校正
raw = mne_nirs.optical_density(raw)
# 信号质量评估
raw = mne_nirs.scalp_coupling_index(raw)
# 基线校正
raw = mne_nirs.baseline_correction(raw)
# 时间对齐
raw = mne_nirs.time_shift(raw)
# 计算心理学指标
epochs = mne.Epochs(raw, events=events, tmin=-5, tmax=25,
baseline=(-5, 0), reject=dict(hbo=100e-6))
tfd = mne_nirs.time_frequency_derivative(epochs)
```
这是一个简单的示例,演示了如何使用mne-nirs处理fNIRS数据。你可以使用mne-nirs文档中提供的更多功能来处理你的数据。
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