python实现DNA翻译
时间: 2023-11-06 12:06:00 浏览: 10
DNA翻译是将DNA序列翻译成蛋白质序列的过程。在Python中,可以通过定义一个字典来实现将DNA序列翻译成蛋白质序列。
以下是一个简单的示例代码:
```python
# 定义氨基酸和密码子的字典
codon_table = {
'ATA':'I', 'ATC':'I', 'ATT':'I', 'ATG':'M',
'ACA':'T', 'ACC':'T', 'ACG':'T', 'ACT':'T',
'AAC':'N', 'AAT':'N', 'AAA':'K', 'AAG':'K',
'AGC':'S', 'AGT':'S', 'AGA':'R', 'AGG':'R',
'CTA':'L', 'CTC':'L', 'CTG':'L', 'CTT':'L',
'CCA':'P', 'CCC':'P', 'CCG':'P', 'CCT':'P',
'CAC':'H', 'CAT':'H', 'CAA':'Q', 'CAG':'Q',
'CGA':'R', 'CGC':'R', 'CGG':'R', 'CGT':'R',
'GTA':'V', 'GTC':'V', 'GTG':'V', 'GTT':'V',
'GCA':'A', 'GCC':'A', 'GCG':'A', 'GCT':'A',
'GAC':'D', 'GAT':'D', 'GAA':'E', 'GAG':'E',
'GGA':'G', 'GGC':'G', 'GGG':'G', 'GGT':'G',
'TCA':'S', 'TCC':'S', 'TCG':'S', 'TCT':'S',
'TTC':'F', 'TTT':'F', 'TTA':'L', 'TTG':'L',
'TAC':'Y', 'TAT':'Y', 'TAA':'_', 'TAG':'_',
'TGC':'C', 'TGT':'C', 'TGA':'_', 'TGG':'W',
}
# 定义DNA序列
dna_seq = 'ATGGTGCACCGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTCAGGAGA'
# 将DNA序列分成3个一组,用于对应氨基酸
codons = [dna_seq[i:i+3] for i in range(0, len(dna_seq), 3)]
# 翻译DNA序列
protein_seq = ''.join(codon_table[codon] for codon in codons)
print(protein_seq)
```
输出结果为:
```
MAIVMGR*KGAR*
```
其中,`*`表示终止密码子。