ChIP-Seq（染色质免疫沉淀测序）

ChIP-Seq（染色质免疫沉淀测序）是一种用于分析蛋白质-DNA相互作用并鉴定蛋白质结合位点的技术[^2]。它结合了染色质免疫沉淀（ChIP）和高通量测序技术，可以帮助研究人员了解基因组中蛋白质与DNA的相互作用。

ChIP-Seq的工作流程如下：
1. 染色质免疫沉淀（ChIP）：首先，通过交联蛋白质与DNA，然后使用特定的抗体选择性地沉淀下与特定蛋白质结合的DNA片段。
2. DNA片段准备：将沉淀下的DNA片段进行解交联，并进行适当的处理，如酶切或PCR扩增，以准备测序所需的DNA库。
3. 高通量测序：将DNA库进行高通量测序，生成大量的短序列读取。
4. 数据分析：对测序数据进行质量控制、比对到参考基因组、寻找蛋白质结合位点等一系列分析步骤。

通过ChIP-Seq技术，研究人员可以确定蛋白质与DNA的结合位点，进而了解基因调控、表观遗传学和疾病发生机制等方面的信息[^1]。