star比对输出的.log文件都包括哪些信息,详细一点

时间: 2023-04-03 22:05:22 浏览: 63
star比对输出的.log文件包括以下信息: 1. 比对的序列文件名 2. 比对的参考基因组文件名 3. 比对的参数设置 4. 比对的总体统计信息,如比对的总reads数、比对成功的reads数、比对失败的reads数等 5. 每个比对结果的详细信息,如比对位置、比对得分、比对质量等 6. 比对结果的统计信息,如比对成功率、比对错误率、比对覆盖率等。
相关问题

star比对输出的.log文件

这个问题属于技术问题,我可以回答。在使用star比对时,可以通过添加参数--outFileNamePrefix来指定输出文件的前缀,比如--outFileNamePrefix output,那么输出的.log文件就是outputLog.final.out。该文件包含了比对的统计信息和质量评估等结果。

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