star比对输出的.log文件都包括哪些信息,详细一点
时间: 2023-04-03 22:05:22 浏览: 63
star比对输出的.log文件包括以下信息:
1. 比对的序列文件名
2. 比对的参考基因组文件名
3. 比对的参数设置
4. 比对的总体统计信息,如比对的总reads数、比对成功的reads数、比对失败的reads数等
5. 每个比对结果的详细信息,如比对位置、比对得分、比对质量等
6. 比对结果的统计信息,如比对成功率、比对错误率、比对覆盖率等。
相关问题
star比对输出的.log文件
这个问题属于技术问题,我可以回答。在使用star比对时,可以通过添加参数--outFileNamePrefix来指定输出文件的前缀,比如--outFileNamePrefix output,那么输出的.log文件就是outputLog.final.out。该文件包含了比对的统计信息和质量评估等结果。
Star-CCM都有哪些模块
Star-CCM+ 是一种多物理场仿真软件,具有广泛的应用范围,包括流体动力学、传热、化学反应、结构力学、电磁、声学等。其主要模块包括:
1. 流体流动模块 Fluid Flow:用于模拟流体的流动、湍流、传热和化学反应等现象。
2. 多相流模块 Multiphase Flow:用于模拟多种相态的流体现象,例如空气与水的相互作用、泡沫、液滴和气泡等。
3. 热传递模块 Heat Transfer:用于模拟传热现象,例如对流、辐射和传导等。
4. 化学反应模块 Chemistry:用于模拟化学反应过程,例如燃烧、氧化和还原等。
5. 结构力学模块 Structural Mechanics:用于模拟结构物的强度、振动、疲劳等问题。
6. 电磁模块 Electromagnetics:用于模拟电磁现象,例如电场、磁场和电磁波等。
7. 声学模块 Acoustics:用于模拟声学现象,例如声波、噪声和振动等。
此外,Star-CCM+ 还提供了一些其他的模块,例如自动网格划分模块 Meshing,用于快速生成高质量的网格;以及耦合模块 Coupling,用于将不同物理场之间的相互作用进行耦合求解。