请按下述要求为我输出R语言代码:将lung的数据按7:3分为训练组和对照组,使用训练组的数据构建COX回归模型并绘制3年及5年生存预测ROC曲线,并使用构建的COX回归模型绘制验证组的3年及5年生存预测ROC曲线
时间: 2024-01-24 12:17:59 浏览: 119
以下是R语言代码的实现:
```R
# 导入必要的包
library(survival)
library(survROC)
# 导入lung数据集
data(lung)
# 将数据随机分为训练组和验证组
set.seed(123)
trainIndex <- sample(1:nrow(lung), round(0.7*nrow(lung)), replace = FALSE)
train <- lung[trainIndex, ]
test <- lung[-trainIndex, ]
# 构建COX回归模型
coxModel <- coxph(Surv(time, status) ~ age + sex + ph.ecog + wt.loss, data = train)
# 计算训练组的生存预测ROC曲线
trainPred <- predict(coxModel, type = "lp")
trainROC <- survroc(response = train$status, predictor = trainPred,
time = train$time, event = "death",
verbose = FALSE)
plot(trainROC, col = "red", main = "Train ROC Curve")
# 计算验证组的生存预测ROC曲线
testPred <- predict(coxModel, newdata = test, type = "lp")
testROC <- survroc(response = test$status, predictor = testPred,
time = test$time, event = "death",
verbose = FALSE)
plot(testROC, col = "blue", add = TRUE, lty = 2, cex = 0.8,
main = "Train and Test ROC Curves")
legend("bottomright", legend = c("Train", "Test"),
col = c("red", "blue"), lty = c(1, 2), cex = 0.8)
```
上述代码中,首先导入了`survival`和`survROC`两个包,并将`lung`数据集随机分为训练组和验证组。然后,使用训练组的数据构建COX回归模型,并计算训练组和验证组的生存预测ROC曲线。最后,使用`plot`函数将两条ROC曲线绘制在同一张图中,并添加图例。
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