install.packages("~/celldex_1.0.0.tar.gz", repos = NULL, type = "source") Warning in install.packages : 正在使用‘celldex’这个程序包,因此不会被安装怎样解决
时间: 2024-12-04 22:23:39 浏览: 60
这段代码看起来是在R语言中尝试安装一个名为"celldex_1.0.0.tar.gz"的源代码包。`install.packages()`函数通常用于从CRAN仓库下载并安装R包,但是当它接收到本地路径时(`repos = NULL`意味着不从远程仓库),它会警告说不会自动安装。
如果你已经将包文件解压到指定路径,并希望手动安装,可以按照以下步骤操作:
1. 首先,确认包的tar.gz文件位于`~/celldex_1.0.0.tar.gz`的位置,即你的主目录下。
2. 使用`untar()`或类似工具解压缩该文件,将其内容放在合适的地方,如`~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2/`(假设你的R版本是4.2)。你可以使用命令行解压缩,例如:
```
tar -xzf ~/celldex_1.0.0.tar.gz -C ~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2/
```
3. 解压缩后,你需要使用`install_dir()`或`load_all()`(如果包支持)来自动加载包。例如:
```r
library(devtools)
install_dir("~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2/")
library(celldex) # 现在你应该能加载和使用celldex包了
```
如果包需要进一步配置或其他特殊步骤,通常会在包内的`DESCRIPTION`或`NAMESPACE`文件中有所说明。
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R语言想安装CluMix,运行install.packages("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/CluMix/CluMix_2.1.tar.gz", repos = NULL, type = "source") 。运行之后报错,报错如下:ERROR: dependencies 'extracat', 'marray', 'Biobase' are not available for package 'CluMix' * removing 'C:/Users/lyang/AppData/Local/R/win-library/4.2/CluMix' Warning in install.packages : 安装程序包‘C:/Users/lyang/AppData/Local/Temp/Rtmp67pSZr/downloaded_packages/CluMix_2.1.tar.gz’时退出狀態的值不是0 怎么解决
这个错误是由于安装 CluMix 时缺少依赖的 R 包。在安装 CluMix 之前,你需要先安装它所需要的依赖包 extracat、marray 和 Biobase。可以使用以下命令安装:
```r
install.packages(c("extracat", "marray", "Biobase"))
```
然后再重新运行 CluMix 的安装命令:
```r
install.packages("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/CluMix/CluMix_2.1.tar.gz", repos = NULL, type = "source")
```
这样应该就可以成功安装 CluMix 了。
R语言想安装CluMix,运行install.packages("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/CluMix/CluMix_0.3.tar.gz", repos = NULL, type = "source") 。运行之后报错,报错如下:ERROR: dependencies 'ClustOfVar', 'Hmisc', 'DescTools', 'extracat', 'marray', 'FD', 'gplots' are not available for package 'CluMix' * removing 'C:/Users/lyang/AppData/Local/R/win-library/4.2/CluMix' Warning in install.packages : 安装程序包‘C:/Users/lyang/AppData/Local/Temp/Rtmp67pSZr/downloaded_packages/CluMix_0.3.tar.gz’时退出狀態的值不是0 怎么解决
这个错误提示是因为安装 CluMix 包需要先安装其依赖包。你可以尝试手动安装这些依赖包,具体命令如下:
```R
install.packages(c("ClustOfVar", "Hmisc", "DescTools", "extracat", "marray", "FD", "gplots"))
```
安装完成之后再运行你原来的安装命令即可。如果依然安装失败,可以尝试将 R 语言升级到最新版本或者在安装时加上 `--no-multiarch` 参数。例如:
```R
install.packages("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/CluMix/CluMix_0.3.tar.gz", repos = NULL, type = "source", INSTALL_opts = '--no-multiarch')
```
希望能帮到你!
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