ValueError: could not convert string to float: 'INTRA:'

这个错误通常表示在解析PDBQT文件时出现了问题。根据错误信息，它无法将字符串"INTRA:"转换为浮点数。

PDBQT文件中的对接分数通常以以下格式出现：

REMARK VINA RESULT:    -7.845      0.000      0.000

然而，有时候可能会出现其他以"REMARK"开头的行，其中包含类似于"INTRA:"的字符。

为了解决这个问题，你可以修改代码以更准确地提取对接分数。以下是一个更新的示例代码：

def extract_scores(filename):
    scores = []
    with open(filename, 'r') as file:
        for line in file:
            if line.startswith('REMARK VINA RESULT:'):
                parts = line.split()
                try:
                    score = float(parts[3])
                    scores.append(score)
                except ValueError:
                    print(f"Error parsing score on line: {line}")
    return scores

# 提取对接分数
scores = extract_scores('output.pdbqt')

# 打印对接分数
for i, score in enumerate(scores):
    print(f'Docking score for ligand {i+1}: {score}')

这样的代码逻辑与之前提供的示例代码相似。我们仍然使用`startswith`来检查行是否以"REMARK VINA RESULT:"开头，并使用`split()`将行拆分为部分。然后，我们尝试将第四个部分（`parts[3]`）转换为浮点数。

如果无法转换，就会捕获`ValueError`并打印出错误消息。

这样可以避免在无法正确解析对接分数时引发异常，并允许你查看具体出错的行。

希望这可以解决你遇到的问题！如果还有其他问题，请随时提问。