.xyz文件_RDKit | 可视化分子来自于xyz文件
时间: 2024-03-25 16:36:05 浏览: 86
您可以使用RDKit库来可视化来自于.xyz文件的分子。下面是一个使用RDKit库的Python代码示例:
```python
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import AllChem
from rdkit.Chem.Draw import IPythonConsole
# 读取.xyz文件
mol = Chem.MolFromMolFile('your_file_name.xyz')
# 生成3D坐标
AllChem.Compute2DCoords(mol)
# 显示分子
mol
```
这将生成一个3D分子的可视化图像,并在Jupyter Notebook中显示。您可以通过更改文件路径和名称来适应您的文件。
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