这个configuration.ini里的control_files是什么意思
时间: 2024-03-12 21:47:58 浏览: 171
程序控制文件
感谢您的追问。在WGSA中,control_files是指对照组的测序数据文件路径。对照组是指与您的样本组相对比的一组测序数据,用于进行结构变异和拷贝数变异的差异分析。对照组通常是来自同一种生物的其它个体或者同一种生物不同组织类型的样本。如果您的分析目标是检测人类疾病相关的变异,建议您选择来自同一种族、性别、年龄和生活环境相似的个体作为对照组。
在configuration.ini文件中,control_files参数可以指定多个对照组的测序数据文件路径,多个文件之间用逗号分隔。例如,如果您的对照组有两个测序数据文件,可以在配置文件中指定如下:
```
control_files = /path/to/control1_R1.fq.gz,/path/to/control1_R2.fq.gz,/path/to/control2_R1.fq.gz,/path/to/control2_R2.fq.gz
```
需要注意的是,对照组的测序数据应该与您的样本组使用相同的测序平台和测序深度,以保证分析结果的可靠性。同时,对照组的数据量应该足够大,以保证分析结果的统计学意义。
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