python不用第三方库计算多维数据的距离,进行dbscan聚类
时间: 2024-03-24 11:40:50 浏览: 96
密度聚类dbscan算法—python代码实现(含二维三维案例、截图、说明手册等)
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首先,计算多维数据的距离可以使用欧氏距离公式,该公式如下:
```
distance = sqrt((x1 - y1)**2 + (x2 - y2)**2 + ... + (xn - yn)**2)
```
其中,x1, x2, ..., xn 和 y1, y2, ..., yn 分别表示多维数据中的各维特征值。
然后,可以使用以下代码实现 dbscan 聚类:
```python
import math
def euclidean_distance(x, y):
"""
计算欧氏距离
"""
distance = 0.0
for i in range(len(x)):
distance += (x[i] - y[i]) ** 2
return math.sqrt(distance)
def dbscan(data, eps, min_pts):
"""
dbscan 聚类
"""
clusters = []
visited = set()
for i in range(len(data)):
if i in visited:
continue
visited.add(i)
neighbors = []
for j in range(len(data)):
if euclidean_distance(data[i], data[j]) <= eps:
neighbors.append(j)
if len(neighbors) < min_pts:
continue
cluster = [i]
for k in neighbors:
if k in visited:
continue
visited.add(k)
sub_neighbors = []
for j in range(len(data)):
if euclidean_distance(data[k], data[j]) <= eps:
sub_neighbors.append(j)
if len(sub_neighbors) >= min_pts:
neighbors.extend(sub_neighbors)
if k not in cluster:
cluster.append(k)
clusters.append(cluster)
return clusters
```
其中,`data` 表示多维数据,`eps` 表示邻域半径,`min_pts` 表示最小点数。函数返回一个列表,其中每个元素表示一个聚类,包含多个数据点的下标。
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