SEED脑电数据集的预处理python
时间: 2023-10-14 08:17:43 浏览: 298
数据预处理
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SEED脑电数据集的预处理主要包括以下步骤:
1. 导入数据:使用Python中的pandas库读取SEED脑电数据集的CSV文件,将数据存储到DataFrame中。
2. 数据清洗:删除无用的列和行,去除缺失值和异常值,确保数据的质量。
3. 信号滤波:使用滤波器对原始脑电信号进行预处理,去除高频和低频噪声。
4. 信号分割:将连续的脑电信号分割成一段段固定长度的小块,以便进行后续处理。
5. 特征提取:从每个小块中提取出有意义的特征,如功率谱密度、时域特征、频域特征等。
6. 数据标准化:对提取出的特征进行标准化处理,以消除不同特征之间的量纲差异,使得它们可以进行比较。
7. 数据降维:使用PCA等降维算法将高维特征映射到低维空间中,以减少数据的维度和复杂度。
8. 数据划分:将处理后的数据划分为训练集、验证集和测试集,以便进行模型训练和测试。
9. 数据保存:将处理后的数据保存到本地文件中,以便后续使用。
下面是使用Python代码实现SEED脑电数据集的预处理的示例:
```python
import pandas as pd
import numpy as np
from scipy import signal
from sklearn.decomposition import PCA
# 导入数据
data = pd.read_csv('SEED.csv')
# 数据清洗
data.drop(['Unnamed: 0', 'id'], axis=1, inplace=True) # 删除无用的列
data.dropna(inplace=True) # 删除缺失值
data = data[(data['label'] == 1) | (data['label'] == 2)] # 只保留正常和精神异常的数据
# 信号滤波
fs = 256 # 采样频率
lowcut = 0.5 # 低通滤波截止频率
highcut = 30 # 高通滤波截止频率
order = 4 # 滤波器阶数
def butter_bandpass_filter(data, lowcut, highcut, fs, order):
nyq = 0.5 * fs
low = lowcut / nyq
high = highcut / nyq
b, a = signal.butter(order, [low, high], btype='band')
y = signal.filtfilt(b, a, data)
return y
data['filtered'] = data['eeg'].apply(lambda x: butter_bandpass_filter(x, lowcut, highcut, fs, order))
# 信号分割
segment_length = 256 # 分段长度
segments = []
for i in range(0, len(data), segment_length):
segment = data.iloc[i:i+segment_length]
if len(segment) == segment_length:
segments.append(segment)
# 特征提取
def extract_features(segment):
power, freqs = psd(segment['filtered'], fs=fs, nperseg=256, noverlap=128)
mean_power = np.mean(power, axis=0)
max_power = np.max(power, axis=0)
min_power = np.min(power, axis=0)
std_power = np.std(power, axis=0)
skew_power = skew(power, axis=0)
kurt_power = kurtosis(power, axis=0)
features = np.concatenate([mean_power, max_power, min_power, std_power, skew_power, kurt_power])
return features
X = np.array([extract_features(segment) for segment in segments])
y = np.array([segment['label'].iloc[0] for segment in segments])
# 数据标准化
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
scaler = StandardScaler()
X_scaled = scaler.fit_transform(X)
# 数据降维
pca = PCA(n_components=10)
X_pca = pca.fit_transform(X_scaled)
# 数据划分
from sklearn.model_selection import train_test_split
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X_pca, y, test_size=0.2, random_state=0)
# 数据保存
np.savez('SEED_processed.npz', X_train=X_train, y_train=y_train, X_test=X_test, y_test=y_test)
```
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