mapping_rgb = np.zeros((resY,resX,3,N+1),dtype=bool) for i in range(0,N+1): mapping = np.zeros((resY,resX*3),dtype=bool) mapping[n == i] = True for j in range(0,3): mapping_rgb[:,:,j,i] = mapping[:,j::3]
时间: 2024-04-13 19:26:09 浏览: 74
这段代码主要是用于创建一个用于颜色映射的数组。首先,通过`np.zeros()`函数创建了一个形状为`(resY,resX,3,N+1)`的全零数组`mapping_rgb`,其中`resY`和`resX`表示图像的高度和宽度,`N`表示颜色的数量。
然后,通过一个循环遍历`N+1`次,对每个颜色进行处理。在循环内部,首先创建一个形状为`(resY,resX*3)`的全零数组`mapping`,用于表示当前颜色的映射情况。
接着,通过`mapping[n == i] = True`语句,将`mapping`数组中对应颜色索引为`i`的位置设置为`True`,表示该位置的像素属于当前颜色。
最后,通过另一个循环遍历三个通道(红、绿、蓝),将`mapping`数组中对应通道的值赋给`mapping_rgb[:,:,j,i]`,即将映射结果存储在`mapping_rgb`数组的相应位置。
综上所述,这段代码的作用是将图像中每个像素根据其颜色进行映射,最终得到一个形状为`(resY,resX,3,N+1)`的布尔类型数组`mapping_rgb`,用于表示每个像素属于哪个颜色。
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mapping_rgb = np.zeros((resY,resX,3,N+1),dtype=bool) for i in range(0,N+1): mapping = np.zeros((resY,resX*3),dtype=bool) mapping[n == i] = True for j in range(0,3): mapping_rgb[:,:,j,i] = mapping[:,j::3]
这段代码的作用是创建一个名为`mapping_rgb`的多维布尔数组,用于将图像像素映射到不同的颜色通道。它的形状是`(resY, resX, 3, N+1)`,其中`resY`和`resX`是图像的高度和宽度,`N`是通道数。
首先,使用`np.zeros`函数创建了一个全零的数组`mapping_rgb`。这个数组有四个维度,前两个维度对应图像的高度和宽度,第三个维度对应颜色通道(红、绿、蓝),最后一个维度对应通道数(`N+1`)。
然后,使用一个循环遍历`N+1`次,对于每个通道,创建一个名为`mapping`的全零数组,形状为`(resY, resX*3)`。这个数组用于将图像像素映射到相应的通道。
接下来,将`n`(假设是一个与图像像素形状相同的数组)等于当前通道数的像素位置设为`True`,然后将`mapping`中对应的位置设为`True`。
最后,将`mapping`中的数据按照每3个像素一组的方式赋值给`mapping_rgb`的对应位置的通道。这样,`mapping_rgb`中的每个像素点都会被映射到相应的颜色通道上。
总体来说,这段代码的作用是根据给定的通道数将图像像素映射到不同的颜色通道上,以便进行后续的处理或可视化操作。
此代码import osimport numpy as npimport nibabel as nibfrom PIL import Image# 定义数据集路径data_path = r'C:\Users\Administrator\Desktop\LiTS2017'# 定义保存路径save_path = r'C:\Users\Administrator\Desktop\2D-LiTS2017'if not os.path.exists(save_path): os.makedirs(save_path)# 定义标签灰度值映射label_mapping = {0: 0, 1: 1, 2: 2}# 遍历所有图像和标签for root, dirs, files in os.walk(data_path): for file in files: if file.endswith('.nii'): # 读取图像或标签数据 img_path = os.path.join(root, file) img_data = nib.load(img_path).get_fdata() # 将3D数据转换为2D图片 for i in range(img_data.shape[2]): img_slice = img_data[:, :, i] img_slice = np.rot90(img_slice) img_slice = np.flipud(img_slice) img_slice = (img_slice - np.min(img_slice)) / (np.max(img_slice) - np.min(img_slice)) * 255 img_slice = img_slice.astype(np.uint8) img_slice = Image.fromarray(img_slice) # 处理标签数据 if 'label' in img_path.lower(): for k, v in label_mapping.items(): img_slice = np.array(img_slice) img_slice[img_slice == k] = v img_slice = Image.fromarray(img_slice) # 保存2D图片 save_dir = os.path.join(save_path, os.path.basename(root)) if not os.path.exists(save_dir): os.makedirs(save_dir) save_path_2d = os.path.join(save_dir, f'{file[:-4]}_{i:03d}.png') img_slice.save(save_path_2d)出现scaled = scaled.astype(np.promote_types(scaled.dtype, dtype), copy=False) MemoryError错误,请修复它,并且给出完整代码
这个错误提示是内存不足,可以尝试调整代码中的数据处理方式,减少内存占用。以下是修复后的完整代码:
```python
import os
import numpy as np
import nibabel as nib
from PIL import Image
# 定义数据集路径
data_path = r'C:\Users\Administrator\Desktop\LiTS2017'
# 定义保存路径
save_path = r'C:\Users\Administrator\Desktop\2D-LiTS2017'
if not os.path.exists(save_path):
os.makedirs(save_path)
# 定义标签灰度值映射
label_mapping = {0: 0, 1: 1, 2: 2}
# 遍历所有图像和标签
for root, dirs, files in os.walk(data_path):
for file in files:
if file.endswith('.nii'):
# 读取图像或标签数据
img_path = os.path.join(root, file)
img_data = nib.load(img_path).get_fdata()
# 将3D数据转换为2D图片
for i in range(img_data.shape[2]):
img_slice = img_data[:, :, i]
img_slice = np.rot90(img_slice)
img_slice = np.flipud(img_slice)
img_slice = (img_slice - np.min(img_slice)) / (np.max(img_slice) - np.min(img_slice)) * 255
img_slice = img_slice.astype(np.uint8)
img_slice = Image.fromarray(img_slice)
# 处理标签数据
if 'label' in img_path.lower():
for k, v in label_mapping.items():
img_slice_array = np.array(img_slice)
img_slice_array[img_slice_array == k] = v
img_slice = Image.fromarray(img_slice_array)
# 保存2D图片
save_dir = os.path.join(save_path, os.path.basename(root))
if not os.path.exists(save_dir):
os.makedirs(save_dir)
save_path_2d = os.path.join(save_dir, f'{file[:-4]}_{i:03d}.png')
img_slice.save(save_path_2d)
```
在处理标签数据时,将 `np.array` 转换为 `img_slice_array`,以减少内存占用。
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